Gen
RPGR
retinitis pigmentosa GTPase regulator
- HGNC 10295↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000156313↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 6103↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- Xp11.4
- Koordinaten
- Chromosom X: 38.284.408–38.327.509 (GRCh38)
- Exons
- 15 Exons über 43,1 kb
- Protein
- 1.152 Aminosäuren
- Vererbung
- X-chromosomal-rezessiv
- Auch bekannt als
- CORDX1
- Frühere Symbole
- CRD, RP3, RP15, COD1
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000645032.1NM_001034853.2
- Locus-Typ
- gene with protein product
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
ReferenzgenomGRCh38hg38
Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.
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Retinitis pigmentosa
- RPGR-bedingte RetinopathieX-chromosomal-rezessiv
Eine Netzhautdystrophie, die durch Veränderungen im RPGR-Gen verursacht wird und die häufigste Ursache der X-chromosomal gebundenen Retinitis pigmentosa ist.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 5 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Eines von 77 Genen, die damit verknüpft sind
Eine Gruppe erblicher Netzhautdystrophien mit fortschreitendem Verlust der Stäbchen- und anschließend der Zapfen-Photorezeptoren. Dies führt zu Nachtblindheit und einem allmählichen Verlust des peripheren Sehvermögens.
- 4 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Vererbung
- X-chromosomal-rezessiv
- Die Veränderung liegt auf dem X-Chromosom. Eine Kopie betrifft daher männliche Personen, die nur ein X-Chromosom haben, während Frauen mit einer Kopie in der Regel Trägerinnen sind. Eine trägerinnende Mutter gibt sie mit einer Wahrscheinlichkeit von eins zu zwei an jedes Kind weiter.
Aufbau von RPGR
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
- Varianten mit Seite
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 4,7 kb der 43,1 kb des Gens aus; 3.459 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest RPGR
551
Positionen in RPGR, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 43,1 kb von RPGR, einschließlich der Introns, und nicht nur die 4,7 kb Exons.
Varianten mit Seite (184)
Die RPGR-Varianten mit Seite hier, zuerst die mit den meisten Review-Sternen. Jede Seite beschreibt den öffentlichen Eintrag von ClinVar zur Variante, niemals ein Ergebnis.
| Variante | HGVS c. | Exon oder Intron | Position (GRCh38) | ClinVar-Klassifikation | Überprüfungsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A308P | c.922G>C | Exon 8 | 38.304.647 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| A365Cfs*12 | c.1092dup | Exon 10 | 38.299.108 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| A781Rfs*34 | c.2340del | Exon 15 | 38.286.658 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.28+1G>A | Intron 1 | 38.327.339 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.28+1G>C | Intron 1 | 38.327.339 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.28+2T>C | Intron 1 | 38.327.338 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.28+2T>G | Intron 1 | 38.327.338 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.29-2A>G | Intron 1 | 38.323.526 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.154+1G>A | Intron 2 | 38.323.398 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.154+3_154+6del | Intron 2 | 38.323.392 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
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Mit RPGR verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die RPGR verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Perifoveal hypoautofluorescence
- Spicular pigmentation of the retina
- Abnormal color vision
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
44 weitere Merkmale anzeigen
- Abnormality of refraction
- Blindness
- Color vision test abnormality
- Inner retinal layer loss on macular OCT
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Limited peripheral vision
- Optic atrophy
- Pendular nystagmus
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Total colorblindness
- Undetectable light-adapted electroretinogram
- Visual impairment
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- Abnormal full-field electroretinogram
- Absent foveal reflex
- Blind spot located at fixation point
- Bulging cornea
- Close sighted
- Color blindness
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Farsightedness
- Glaucoma
- Hypoplasia of the fovea
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Severe near sightedness
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Eccentric visual fixation
- Metamorphopsia
- Photopsia
- Retinal pigment epithelial mottling
- Ring scotoma
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Hypoautofluorescent macular lesion
- Macular degeneration
Abnormality of the respiratory system
- Abnormal sputum
- Neonatal respiratory distress
- Respiratory tract infection
- Wet cough
- Lithoptysis
- Obstructive lung disease
- Partial or complete collapse of part or entire lung
- Peribronchovascular interstitial thickening
4 weitere Merkmale anzeigen
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). RPGR-Gen: retinitis pigmentosa GTPase regulator. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/rpgr
Dante Labs. RPGR-Gen: retinitis pigmentosa GTPase regulator [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/rpgr
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