Gen
RPGR
retinitis pigmentosa GTPase regulator
- HGNC 10295↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000156313↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6103↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- Xp11.4
- Coördinaten
- Chromosoom X: 38.284.408–38.327.509 (GRCh38)
- Exons
- 15 exons over 43,1 kb
- Eiwit
- 1.152 aminozuren
- Overerving
- X-gebonden recessief
- Ook bekend als
- CORDX1
- Eerdere symbolen
- CRD, RP3, RP15, COD1
- MANE Select-transcript
- ENST00000645032.1NM_001034853.2
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees RPGR en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Retinitis Pigmentosa
- RPGR-gerelateerde retinopathieX-gebonden recessief
Een retinale dystrofie veroorzaakt door veranderingen in het RPGR-gen, de meest voorkomende oorzaak van X-gebonden retinitis pigmentosa.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Een van 77 genen die hiermee verband houden
Een groep erfelijke retinale dystrofieën met een progressief verlies van staafjes en daarna kegeltjes, wat leidt tot nachtblindheid en geleidelijk verlies van het perifere gezichtsveld.
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overerving
- X-gebonden recessief
- De verandering zit op het X-chromosoom, dus één kopie heeft effect bij mannen, die één X-chromosoom hebben. Vrouwen met één kopie zijn meestal dragers. Een moeder die drager is, geeft de verandering met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van RPGR
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,7 kb van de 43,1 kb van het gen; 3.459 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest RPGR leest
551
posities in RPGR waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 43,1 kb van RPGR, inclusief introns, en niet alleen de 4,7 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (184)
De RPGR-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A308P | c.922G>C | Exon 8 | 38.304.647 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A365Cfs*12 | c.1092dup | Exon 10 | 38.299.108 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A781Rfs*34 | c.2340del | Exon 15 | 38.286.658 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.28+1G>A | Intron 1 | 38.327.339 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.28+1G>C | Intron 1 | 38.327.339 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.28+2T>C | Intron 1 | 38.327.338 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.28+2T>G | Intron 1 | 38.327.338 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.29-2A>G | Intron 1 | 38.323.526 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.154+1G>A | Intron 2 | 38.323.398 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.154+3_154+6del | Intron 2 | 38.323.392 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Deelt 1 aandoening
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Deelt 1 aandoening
- AHRaryl hydrocarbon receptorDeelt 1 aandoening
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Deelt 1 aandoening
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDeelt 1 aandoening
- ARL3ARF like GTPase 3Deelt 1 aandoening
- ARL6ARF like GTPase 6Deelt 1 aandoening
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Deelt 1 aandoening
- BEST1bestrophin 1Deelt 1 aandoening
- CA4carbonic anhydrase 4Deelt 1 aandoening
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ADeelt 1 aandoening
- CDHR1cadherin related family member 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan RPGR
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RPGR kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Perifoveal hypoautofluorescence
- Spicular pigmentation of the retina
- Abnormal color vision
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
Toon 44 kenmerken meer
- Abnormality of refraction
- Blindness
- Color vision test abnormality
- Inner retinal layer loss on macular OCT
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Limited peripheral vision
- Optic atrophy
- Pendular nystagmus
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Total colorblindness
- Undetectable light-adapted electroretinogram
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Absent foveal reflex
- Blind spot located at fixation point
- Bulging cornea
- Close sighted
- Color blindness
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Farsightedness
- Glaucoma
- Hypoplasia of the fovea
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Severe near sightedness
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Eccentric visual fixation
- Metamorphopsia
- Photopsia
- Retinal pigment epithelial mottling
- Ring scotoma
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Hypoautofluorescent macular lesion
- Macular degeneration
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RPGR-gen: retinitis pigmentosa GTPase regulator. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/rpgr
Dante Labs. RPGR-gen: retinitis pigmentosa GTPase regulator [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/rpgr
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken