Gen
PYCR2
pyrroline-5-carboxylate reductase 2
- HGNC 30262↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000143811↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 29920↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1q42.12
- Souřadnice
- Chromozom 1: 225 919 878–225 924 250 (GRCh38)
- Exony
- 7 exonů na 4,4 kb
- Protein
- 320 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- P5CR2
- Transkript MANE Select
- ENST00000343818.11NM_013328.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PYCR2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Pelizaeus-Merzbacher Disease & Hypomyelinating Leukodystrophies
- Hypomyelinating leukodystrophy 10 (PYCR2)Autozomálně recesivní
A rare inherited form of hypomyelinating leukodystrophy, in which myelin in the brain does not form normally, causing delayed development and movement problems.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
Jeden z 80 genů spojených s touto vazbou
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je PYCR2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,7 kb z 4,4 kb genu; 963 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PYCR2
24
pozic v genu PYCR2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 4,4 kb genu PYCR2, včetně intronů, nikoli jen 1,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Sdílí 1 onemocnění
- ACER3alkaline ceramidase 3Sdílí 1 onemocnění
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 1 onemocnění
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Sdílí 1 onemocnění
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Sdílí 1 onemocnění
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Sdílí 1 onemocnění
- ARSAarylsulfatase ASdílí 1 onemocnění
- ASPAaspartoacylaseSdílí 1 onemocnění
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ASdílí 1 onemocnění
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s PYCR2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PYCR2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- CNS hypomyelination
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Reduced cerebral white matter volume
- Small brainstem
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Absent speech development
- Gray matter heterotopia
Zobrazit ještě 25 rysů
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- Severe global developmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Epilepsy
- Fewer and broader ridges in brain
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
- Severe demyelination of the white matter
- Underdeveloped frontal lobe
- Ventriculomegaly
- Abnormal gait
- Aggressive behavior
- Ataxia
- Focal myoclonic seizure
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Irritability
- Poor speech
- Babinski sign
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebrum
- Hyperactive movements
- Leukodystrophy
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle degeneration
- Abnormal cortical bone morphology
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Abnormality of the skeletal system
- Double-Jointed
- Flexed joint that cannot be straightened
- Increased wrist mobility
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PYCR2: pyrroline-5-carboxylate reductase 2. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pycr2
Dante Labs. Gen PYCR2: pyrroline-5-carboxylate reductase 2 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pycr2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů