Geeni
PYCR2
pyrroline-5-carboxylate reductase 2
- HGNC 30262↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000143811↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 29920↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q42.12
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 225 919 878–225 924 250 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 4,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 320 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- P5CR2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000343818.11NM_013328.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PYCR2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Pelizaeus-Merzbacherin tauti ja hypomyelinoivat leukodystrofiat
- Hypomyelinoiva leukodystrofia 10 (PYCR2)Autosomaalinen resessiivinen
Harvinainen perinnöllinen hypomyelinoivan leukodystrofian muoto, jossa aivojen myeliinituppi ei muodostu normaalisti, mikä aiheuttaa viivästynyttä kehitystä ja liikeoireita.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Muut perinnölliset leukodystrofiat
- Leukodystrofia (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 80 siihen liittyvästä geenistä
Perinnölliset sairaudet, jotka vahingoittavat myeliinituppea eli aivojen ja selkäytimen valkeaa ainetta tai estävät sen normaalin muodostumisen. Eri tyypit periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, autosomaalisesti dominantisti tai X-kromosomaalisesti sen mukaan, mikä geeni on kyseessä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedossa oleva geneettinen syy voi lopettaa diagnoosin etsimisen, ohjata tukihoitoa ja seurantaa, osoittaa, onko olemassa tiettyä hoitoa, sekä mahdollistaa sukulaisten testauksen.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PYCR2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,7 kb geenin 4,4 kb:stä; 963 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PYCR2
24
PYCR2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 4,4 kb geenistä PYCR2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteinen sairaus: 1
- ACER3alkaline ceramidase 3Yhteinen sairaus: 1
- ADARadenosine deaminase RNA specificYhteinen sairaus: 1
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Yhteinen sairaus: 1
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Yhteinen sairaus: 1
- ARSAarylsulfatase AYhteinen sairaus: 1
- ASPAaspartoacylaseYhteinen sairaus: 1
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AYhteinen sairaus: 1
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin PYCR2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PYCR2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- CNS hypomyelination
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Reduced cerebral white matter volume
- Small brainstem
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Absent speech development
- Gray matter heterotopia
Näytä 25 piirrettä lisää
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- Severe global developmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Epilepsy
- Fewer and broader ridges in brain
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
- Severe demyelination of the white matter
- Underdeveloped frontal lobe
- Ventriculomegaly
- Abnormal gait
- Aggressive behavior
- Ataxia
- Focal myoclonic seizure
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Irritability
- Poor speech
- Babinski sign
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebrum
- Hyperactive movements
- Leukodystrophy
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle degeneration
- Abnormal cortical bone morphology
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Abnormality of the skeletal system
- Double-Jointed
- Flexed joint that cannot be straightened
- Increased wrist mobility
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PYCR2-geeni: pyrroline-5-carboxylate reductase 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pycr2
Dante Labs. PYCR2-geeni: pyrroline-5-carboxylate reductase 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pycr2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa