Genă
SALL1
spalt like transcription factor 1
- HGNC 10524↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000103449↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6299↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 16q12.1
- Coordonate
- Cromozomul 16: 51.135.982–51.151.270 (GRCh38)
- Exoni
- 3 de exoni pe 15,3 kb
- Proteină
- 1.324 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- Hsal1, ZNF794
- Simboluri anterioare
- TBS
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000251020.9NM_002968.3
- Tip de locus
- Protein-coding
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sall1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți SALL1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă SALL1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei SALL1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 5,1 kb din cei 15,3 kb ai genei; 3.975 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea SALL1
79
poziții în SALL1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
78 dintre ele (99 %) se află în regiuni pe care citirile scurte le identifică greu.
- Segmental duplications (78 de situri)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genom întreg acoperă toate cele 15,3 kb din SALL1, inclusiv intronii, nu doar cei 5,1 kb de exoni.
Trăsături asociate cu SALL1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca SALL1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of limbs
- Extra thumb
- Finger-like thumb
- Abnormal feet structure
- Broad thumb
- Curvature of little finger
- Dropped arches
- Toe curvature
- 3-4 finger cutaneous syndactyly
Afișați încă 16 de trăsături
- Absent toe
- Absent/small 3rd toe
- Broad bone of big toe
- Finger bends toward pinky
- Fused toes
- Left and right leg differ in length or width
- Partial duplication of the thumb bones
- Talipes
- Webbed 4th-5th toes
- Webbed first and second toes
- Clinodactyly of the 5th toe
- Extra bone on end of second long bone of hand
- Fusion of the long bones of the feet
- Short long bone of foot
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Webbed 3rd-4th toes
Abnormality of the digestive system
- Abnormal connection between rectum and vagina
- Absent anus
- Rectoperineal fistula
- Anteriorly placed anus
- Constipation
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Loss of bowel control
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Afișați încă 3 de trăsături
Abnormality of the ear
- Small ears
- Abnormally shaped ears
- Sensorineural hearing impairment
- Hearing impairment
- Overfolded ears
- Abnormal tragus morphology
- Lop ear
- Large ears
Afișați încă 3 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena SALL1: spalt like transcription factor 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/sall1
Dante Labs. Gena SALL1: spalt like transcription factor 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/sall1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni