Genas
SALL1
spalt like transcription factor 1
- HGNC 10524↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000103449↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6299↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 16q12.1
- Koordinatės
- Chromosoma 16: 51 135 982–51 151 270 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 15,3 kb
- Baltymas
- 1 324 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Hsal1, ZNF794
- Ankstesni simboliai
- TBS
- MANE Select transkriptas
- ENST00000251020.9NM_002968.3
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sall1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SALL1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito SALL1 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas SALL1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 5,1 kb iš 15,3 kb geno; 3 975 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: SALL1
79
vietos geno SALL1 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Iš jų 78 (99 %) patenka į sritis, kuriose trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
- Segmental duplications (78 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 15,3 kb geno SALL1, įskaitant intronus, o ne tik 5,1 kb eksonų.
Savybės, susijusios su SALL1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SALL1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of limbs
- Extra thumb
- Finger-like thumb
- Abnormal feet structure
- Broad thumb
- Curvature of little finger
- Dropped arches
- Toe curvature
- 3-4 finger cutaneous syndactyly
Rodyti dar 16 savybių
- Absent toe
- Absent/small 3rd toe
- Broad bone of big toe
- Finger bends toward pinky
- Fused toes
- Left and right leg differ in length or width
- Partial duplication of the thumb bones
- Talipes
- Webbed 4th-5th toes
- Webbed first and second toes
- Clinodactyly of the 5th toe
- Extra bone on end of second long bone of hand
- Fusion of the long bones of the feet
- Short long bone of foot
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Webbed 3rd-4th toes
Abnormality of the digestive system
- Abnormal connection between rectum and vagina
- Absent anus
- Rectoperineal fistula
- Anteriorly placed anus
- Constipation
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Loss of bowel control
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of the ear
- Small ears
- Abnormally shaped ears
- Sensorineural hearing impairment
- Hearing impairment
- Overfolded ears
- Abnormal tragus morphology
- Lop ear
- Large ears
Rodyti dar 3 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SALL1 genas: spalt like transcription factor 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/sall1
Dante Labs. SALL1 genas: spalt like transcription factor 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/sall1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites