Gen
SALL1
spalt like transcription factor 1
- HGNC 10524↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000103449↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6299↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 16q12.1
- Coördinaten
- Chromosoom 16: 51.135.982–51.151.270 (GRCh38)
- Exons
- 3 exons over 15,3 kb
- Eiwit
- 1.324 aminozuren
- Ook bekend als
- Hsal1, ZNF794
- Eerdere symbolen
- TBS
- MANE Select-transcript
- ENST00000251020.9NM_002968.3
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SALL1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest SALL1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van SALL1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 5,1 kb van de 15,3 kb van het gen; 3.975 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SALL1 leest
79
posities in SALL1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
78 daarvan (99%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Segmental duplications (78 posities)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een volledig genoom dekt alle 15,3 kb van SALL1, inclusief introns, en niet alleen de 5,1 kb aan exonen.
Kenmerken gekoppeld aan SALL1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SALL1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of limbs
- Extra thumb
- Finger-like thumb
- Abnormal feet structure
- Broad thumb
- Curvature of little finger
- Dropped arches
- Toe curvature
- 3-4 finger cutaneous syndactyly
Toon 16 kenmerken meer
- Absent toe
- Absent/small 3rd toe
- Broad bone of big toe
- Finger bends toward pinky
- Fused toes
- Left and right leg differ in length or width
- Partial duplication of the thumb bones
- Talipes
- Webbed 4th-5th toes
- Webbed first and second toes
- Clinodactyly of the 5th toe
- Extra bone on end of second long bone of hand
- Fusion of the long bones of the feet
- Short long bone of foot
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Webbed 3rd-4th toes
Abnormality of the digestive system
- Abnormal connection between rectum and vagina
- Absent anus
- Rectoperineal fistula
- Anteriorly placed anus
- Constipation
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Loss of bowel control
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Toon 3 kenmerken meer
Abnormality of the ear
- Small ears
- Abnormally shaped ears
- Sensorineural hearing impairment
- Hearing impairment
- Overfolded ears
- Abnormal tragus morphology
- Lop ear
- Large ears
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SALL1-gen: spalt like transcription factor 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/sall1
Dante Labs. SALL1-gen: spalt like transcription factor 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/sall1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken