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Gene

CALR

calreticulin

Resumo

Localização citogenética
19p13.13
Coordenadas
Cromossoma 19: 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Exões
9 exões ao longo de 5,9 kb
Proteína
417 aminoácidos
Também conhecido como
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
Transcrito MANE Select
ENST00000316448.10NM_004343.4
Tipo de locus
Protein-coding
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa CALR ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como CALR está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
Cromossoma 19, com um parêntese onde se situa CALR. CALR e 42 genes próximos no cromossoma 19, de 12 441 549 a 13 441 548.Cromossoma 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12 433 103–12 484 816, fita inversaZNF709: 12 461 184–12 513 854, fita inversaZNF709: 12 461 559–12 551 474, fita inversaZNF564: 12 524 903–12 551 542, fita inversaZNF564: 12 525 720–12 580 975, fita inversaZNF490: 12 575 832–12 640 098, fita inversaZNF490ZNF791: 12 610 916–12 633 840, fita diretaZNF791MAN2B1: 12 643 831–12 666 762, fita inversa: 12 643 831–12 648 397, fita inversa: 12 664 828–12 669 397, fita inversaWDR83: 12 666 802–12 675 832, fita diretaWDR83OS: 12 668 065–12 669 467, fita inversa: 12 668 071–12 681 834, fita inversaDHPS: 12 673 411–12 681 901, fita inversaDHPSFBXW9: 12 687 801–12 696 659, fita inversaFBXW9GNG14: 12 687 998–12 688 422, fita diretaGNG14TNPO2: 12 699 111–12 724 011, fita inversaTNPO2TRIR: 12 730 640–12 734 747, fita inversaTRIRGET3: 12 737 139–12 748 325, fita diretaGET3BEST2: 12 751 673–12 758 458, fita diretaBEST2HOOK2: 12 762 640–12 872 740, fita inversaHOOK2JUNB: 12 791 486–12 793 315, fita diretaPRDX2: 12 796 817–12 801 882, fita inversaTHSD8: 12 802 031–12 813 581, fita diretaRNASEH2A: 12 806 505–12 813 644, fita diretaRNASEH2ARTBDN: 12 825 477–12 838 362, fita inversaRTBDNMAST1: 12 833 860–12 874 952, fita diretaMAST1DNASE2: 12 875 209–12 881 595, fita inversaKLF1: 12 884 405–12 887 201, fita inversaGCDH: 12 891 128–12 915 261, fita diretaSYCE2: 12 898 786–12 919 306, fita inversaFARSA: 12 921 138–12 934 037, fita inversaFARSACALR: 12 938 609–12 944 489, fita diretaCALRRAD23A: 12 945 716–12 953 646, fita diretaRAD23AGADD45GIP1: 12 950 701–12 957 333, fita inversaGADD45GIP1DAND5: 12 965 159–12 974 760, fita diretaNFIX: 12 995 401–13 098 796, fita diretaNFIXLYL1: 13 099 028–13 103 188, fita inversaLYL1TRMT1: 13 104 899–13 117 567, fita inversaTRMT1NACC1: 13 116 468–13 141 147, fita diretaNACC1STX10: 13 144 058–13 150 383, fita inversaSTX10IER2: 13 150 403–13 156 981, fita diretaIER2CACNA1A: 13 206 442–13 624 489, fita inversaCACNA1ADiagrama de CALR: 9 exões na cadeia direta do cromossoma 19Exão 9: 2 locais conhecidos associados a doençaExão 1: 12 938 609–12 938 770, 162 basesExão 2: 12 939 134–12 939 235, 102 basesExão 3: 12 939 428–12 939 631, 204 basesExão 4: 12 940 053–12 940 147, 95 basesExão 5: 12 940 243–12 940 452, 210 basesExão 6: 12 940 541–12 940 654, 114 basesExão 7: 12 940 744–12 940 887, 144 basesExão 8: 12 943 537–12 943 629, 93 basesExão 9: 12 943 713–12 944 489, 777 bases1234567895′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 1,9 kb dos 5,9 kb do gene; 1254 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de CALR

2

posições em CALR onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas cai numa região que as leituras curtas dificilmente cobrem.

Um genoma completo cobre todos os 5,9 kb de CALR, incluindo os intrões, e não apenas os 1,9 kb de exões.

Características associadas a CALR

A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que CALR pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.

Abnormality of blood and blood-forming tissues

Mostrar mais 26 características

Ligações externas

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene CALR: calreticulin. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. Gene CALR: calreticulin [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/calr

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