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Gen

CALR

calreticulin

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
19p13.13
Koordinaten
Chromosom 19: 12.938.609–12.944.489 (GRCh38)
Exons
9 Exons über 5,9 kb
Protein
417 Aminosäuren
Auch bekannt als
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
MANE-Select-Transkript
ENST00000316448.10NM_004343.4
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet CALR bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von CALR

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
Chromosom 19, mit einer Klammer, an der CALR liegt. CALR und 42 Gene in der Nähe auf Chromosom 19, von 12.441.549 bis 13.441.548.Chromosom 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12.433.103–12.484.816, Minus-StrangZNF709: 12.461.184–12.513.854, Minus-StrangZNF709: 12.461.559–12.551.474, Minus-StrangZNF564: 12.524.903–12.551.542, Minus-StrangZNF564: 12.525.720–12.580.975, Minus-StrangZNF490: 12.575.832–12.640.098, Minus-StrangZNF490ZNF791: 12.610.916–12.633.840, Plus-StrangZNF791MAN2B1: 12.643.831–12.666.762, Minus-Strang: 12.643.831–12.648.397, Minus-Strang: 12.664.828–12.669.397, Minus-StrangWDR83: 12.666.802–12.675.832, Plus-StrangWDR83OS: 12.668.065–12.669.467, Minus-Strang: 12.668.071–12.681.834, Minus-StrangDHPS: 12.673.411–12.681.901, Minus-StrangDHPSFBXW9: 12.687.801–12.696.659, Minus-StrangFBXW9GNG14: 12.687.998–12.688.422, Plus-StrangGNG14TNPO2: 12.699.111–12.724.011, Minus-StrangTNPO2TRIR: 12.730.640–12.734.747, Minus-StrangTRIRGET3: 12.737.139–12.748.325, Plus-StrangGET3BEST2: 12.751.673–12.758.458, Plus-StrangBEST2HOOK2: 12.762.640–12.872.740, Minus-StrangHOOK2JUNB: 12.791.486–12.793.315, Plus-StrangPRDX2: 12.796.817–12.801.882, Minus-StrangTHSD8: 12.802.031–12.813.581, Plus-StrangRNASEH2A: 12.806.505–12.813.644, Plus-StrangRNASEH2ARTBDN: 12.825.477–12.838.362, Minus-StrangRTBDNMAST1: 12.833.860–12.874.952, Plus-StrangMAST1DNASE2: 12.875.209–12.881.595, Minus-StrangKLF1: 12.884.405–12.887.201, Minus-StrangGCDH: 12.891.128–12.915.261, Plus-StrangSYCE2: 12.898.786–12.919.306, Minus-StrangFARSA: 12.921.138–12.934.037, Minus-StrangFARSACALR: 12.938.609–12.944.489, Plus-StrangCALRRAD23A: 12.945.716–12.953.646, Plus-StrangRAD23AGADD45GIP1: 12.950.701–12.957.333, Minus-StrangGADD45GIP1DAND5: 12.965.159–12.974.760, Plus-StrangNFIX: 12.995.401–13.098.796, Plus-StrangNFIXLYL1: 13.099.028–13.103.188, Minus-StrangLYL1TRMT1: 13.104.899–13.117.567, Minus-StrangTRMT1NACC1: 13.116.468–13.141.147, Plus-StrangNACC1STX10: 13.144.058–13.150.383, Minus-StrangSTX10IER2: 13.150.403–13.156.981, Plus-StrangIER2CACNA1A: 13.206.442–13.624.489, Minus-StrangCACNA1ADiagramm von CALR: 9 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 19Exon 9: 2 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 1: 12.938.609–12.938.770, 162 BasenExon 2: 12.939.134–12.939.235, 102 BasenExon 3: 12.939.428–12.939.631, 204 BasenExon 4: 12.940.053–12.940.147, 95 BasenExon 5: 12.940.243–12.940.452, 210 BasenExon 6: 12.940.541–12.940.654, 114 BasenExon 7: 12.940.744–12.940.887, 144 BasenExon 8: 12.943.537–12.943.629, 93 BasenExon 9: 12.943.713–12.944.489, 777 Basen1234567895′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,9 kb der 5,9 kb des Gens aus; 1.254 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest CALR

2

Positionen in CALR, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 5,9 kb von CALR, einschließlich der Introns, und nicht nur die 1,9 kb Exons.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (o. J.). CALR-Gen: calreticulin. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. CALR-Gen: calreticulin [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/calr

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