Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

CALR

calreticulin

Shrnutí

Cytogenetická poloha
19p13.13
Souřadnice
Chromozom 19: 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Exony
9 exonů na 5,9 kb
Protein
417 aminokyselin
Další názvy
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
Transkript MANE Select
ENST00000316448.10NM_004343.4
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen CALR. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je CALR uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
Chromozom 19, se závorkou u CALR. CALR a 42 genů poblíž na chromozomu 19, od 12 441 549 do 13 441 548.Chromozom 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12 433 103–12 484 816, řetězec zpětnémZNF709: 12 461 184–12 513 854, řetězec zpětnémZNF709: 12 461 559–12 551 474, řetězec zpětnémZNF564: 12 524 903–12 551 542, řetězec zpětnémZNF564: 12 525 720–12 580 975, řetězec zpětnémZNF490: 12 575 832–12 640 098, řetězec zpětnémZNF490ZNF791: 12 610 916–12 633 840, řetězec dopřednémZNF791MAN2B1: 12 643 831–12 666 762, řetězec zpětném: 12 643 831–12 648 397, řetězec zpětném: 12 664 828–12 669 397, řetězec zpětnémWDR83: 12 666 802–12 675 832, řetězec dopřednémWDR83OS: 12 668 065–12 669 467, řetězec zpětném: 12 668 071–12 681 834, řetězec zpětnémDHPS: 12 673 411–12 681 901, řetězec zpětnémDHPSFBXW9: 12 687 801–12 696 659, řetězec zpětnémFBXW9GNG14: 12 687 998–12 688 422, řetězec dopřednémGNG14TNPO2: 12 699 111–12 724 011, řetězec zpětnémTNPO2TRIR: 12 730 640–12 734 747, řetězec zpětnémTRIRGET3: 12 737 139–12 748 325, řetězec dopřednémGET3BEST2: 12 751 673–12 758 458, řetězec dopřednémBEST2HOOK2: 12 762 640–12 872 740, řetězec zpětnémHOOK2JUNB: 12 791 486–12 793 315, řetězec dopřednémPRDX2: 12 796 817–12 801 882, řetězec zpětnémTHSD8: 12 802 031–12 813 581, řetězec dopřednémRNASEH2A: 12 806 505–12 813 644, řetězec dopřednémRNASEH2ARTBDN: 12 825 477–12 838 362, řetězec zpětnémRTBDNMAST1: 12 833 860–12 874 952, řetězec dopřednémMAST1DNASE2: 12 875 209–12 881 595, řetězec zpětnémKLF1: 12 884 405–12 887 201, řetězec zpětnémGCDH: 12 891 128–12 915 261, řetězec dopřednémSYCE2: 12 898 786–12 919 306, řetězec zpětnémFARSA: 12 921 138–12 934 037, řetězec zpětnémFARSACALR: 12 938 609–12 944 489, řetězec dopřednémCALRRAD23A: 12 945 716–12 953 646, řetězec dopřednémRAD23AGADD45GIP1: 12 950 701–12 957 333, řetězec zpětnémGADD45GIP1DAND5: 12 965 159–12 974 760, řetězec dopřednémNFIX: 12 995 401–13 098 796, řetězec dopřednémNFIXLYL1: 13 099 028–13 103 188, řetězec zpětnémLYL1TRMT1: 13 104 899–13 117 567, řetězec zpětnémTRMT1NACC1: 13 116 468–13 141 147, řetězec dopřednémNACC1STX10: 13 144 058–13 150 383, řetězec zpětnémSTX10IER2: 13 150 403–13 156 981, řetězec dopřednémIER2CACNA1A: 13 206 442–13 624 489, řetězec zpětnémCACNA1ASchéma CALR: 9 exonů na dopředném řetězci chromozomu 19Exon 9: 2 známých míst způsobujících onemocněníExon 1: 12 938 609–12 938 770, 162 bázíExon 2: 12 939 134–12 939 235, 102 bázíExon 3: 12 939 428–12 939 631, 204 bázíExon 4: 12 940 053–12 940 147, 95 bázíExon 5: 12 940 243–12 940 452, 210 bázíExon 6: 12 940 541–12 940 654, 114 bázíExon 7: 12 940 744–12 940 887, 144 bázíExon 8: 12 943 537–12 943 629, 93 bázíExon 9: 12 943 713–12 944 489, 777 bází1234567895′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,9 kb z 5,9 kb genu; 1 254 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte CALR

2

pozic v genu CALR, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celý genom pokrývá všech 5,9 kb genu CALR, včetně intronů, nikoli jen 1,9 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen CALR: calreticulin. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. Gen CALR: calreticulin [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/calr

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test