Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

CALR

calreticulin

Sammanfattning

Cytogenetisk position
19p13.13
Koordinater
Kromosom 19: 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Exoner
9 exoner på 5,9 kb
Protein
417 aminosyror
Även känd som
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
MANE Select-transkript
ENST00000316448.10NM_004343.4
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser CALR ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är CALR uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
Kromosom 19, med en parentes där CALR finns. CALR och 42 gener i närheten på kromosom 19, från 12 441 549 till 13 441 548.Kromosom 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12 433 103–12 484 816, bakåt-strängZNF709: 12 461 184–12 513 854, bakåt-strängZNF709: 12 461 559–12 551 474, bakåt-strängZNF564: 12 524 903–12 551 542, bakåt-strängZNF564: 12 525 720–12 580 975, bakåt-strängZNF490: 12 575 832–12 640 098, bakåt-strängZNF490ZNF791: 12 610 916–12 633 840, framåt-strängZNF791MAN2B1: 12 643 831–12 666 762, bakåt-sträng: 12 643 831–12 648 397, bakåt-sträng: 12 664 828–12 669 397, bakåt-strängWDR83: 12 666 802–12 675 832, framåt-strängWDR83OS: 12 668 065–12 669 467, bakåt-sträng: 12 668 071–12 681 834, bakåt-strängDHPS: 12 673 411–12 681 901, bakåt-strängDHPSFBXW9: 12 687 801–12 696 659, bakåt-strängFBXW9GNG14: 12 687 998–12 688 422, framåt-strängGNG14TNPO2: 12 699 111–12 724 011, bakåt-strängTNPO2TRIR: 12 730 640–12 734 747, bakåt-strängTRIRGET3: 12 737 139–12 748 325, framåt-strängGET3BEST2: 12 751 673–12 758 458, framåt-strängBEST2HOOK2: 12 762 640–12 872 740, bakåt-strängHOOK2JUNB: 12 791 486–12 793 315, framåt-strängPRDX2: 12 796 817–12 801 882, bakåt-strängTHSD8: 12 802 031–12 813 581, framåt-strängRNASEH2A: 12 806 505–12 813 644, framåt-strängRNASEH2ARTBDN: 12 825 477–12 838 362, bakåt-strängRTBDNMAST1: 12 833 860–12 874 952, framåt-strängMAST1DNASE2: 12 875 209–12 881 595, bakåt-strängKLF1: 12 884 405–12 887 201, bakåt-strängGCDH: 12 891 128–12 915 261, framåt-strängSYCE2: 12 898 786–12 919 306, bakåt-strängFARSA: 12 921 138–12 934 037, bakåt-strängFARSACALR: 12 938 609–12 944 489, framåt-strängCALRRAD23A: 12 945 716–12 953 646, framåt-strängRAD23AGADD45GIP1: 12 950 701–12 957 333, bakåt-strängGADD45GIP1DAND5: 12 965 159–12 974 760, framåt-strängNFIX: 12 995 401–13 098 796, framåt-strängNFIXLYL1: 13 099 028–13 103 188, bakåt-strängLYL1TRMT1: 13 104 899–13 117 567, bakåt-strängTRMT1NACC1: 13 116 468–13 141 147, framåt-strängNACC1STX10: 13 144 058–13 150 383, bakåt-strängSTX10IER2: 13 150 403–13 156 981, framåt-strängIER2CACNA1A: 13 206 442–13 624 489, bakåt-strängCACNA1ADiagram över CALR: 9 exoner på framåt-strängen av kromosom 19Exon 9: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 1: 12 938 609–12 938 770, 162 baserExon 2: 12 939 134–12 939 235, 102 baserExon 3: 12 939 428–12 939 631, 204 baserExon 4: 12 940 053–12 940 147, 95 baserExon 5: 12 940 243–12 940 452, 210 baserExon 6: 12 940 541–12 940 654, 114 baserExon 7: 12 940 744–12 940 887, 144 baserExon 8: 12 943 537–12 943 629, 93 baserExon 9: 12 943 713–12 944 489, 777 baser1234567895′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 1,9 kb av genens 5,9 kb, och 1 254 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest CALR

2

positioner i CALR där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsanalys täcker alla 5,9 kb av CALR, med introner inräknade, inte bara de 1,9 kb exoner.

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). CALR-genen: calreticulin. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. CALR-genen: calreticulin [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/calr

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test