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Gène

CALR

calreticulin

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13.13
Coordonnées
Chromosome 19 : 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 5,9 kb
Protéine
417 acides aminés
Aussi appelé
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
Transcrit MANE Select
ENST00000316448.10NM_004343.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CALR. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CALR

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de CALR. CALR et 42 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 12 441 549 à 13 441 548.Chromosome 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb : 12 433 103–12 484 816, brin inverseZNF709 : 12 461 184–12 513 854, brin inverseZNF709 : 12 461 559–12 551 474, brin inverseZNF564 : 12 524 903–12 551 542, brin inverseZNF564 : 12 525 720–12 580 975, brin inverseZNF490 : 12 575 832–12 640 098, brin inverseZNF490ZNF791 : 12 610 916–12 633 840, brin directZNF791MAN2B1 : 12 643 831–12 666 762, brin inverse : 12 643 831–12 648 397, brin inverse : 12 664 828–12 669 397, brin inverseWDR83 : 12 666 802–12 675 832, brin directWDR83OS : 12 668 065–12 669 467, brin inverse : 12 668 071–12 681 834, brin inverseDHPS : 12 673 411–12 681 901, brin inverseDHPSFBXW9 : 12 687 801–12 696 659, brin inverseFBXW9GNG14 : 12 687 998–12 688 422, brin directGNG14TNPO2 : 12 699 111–12 724 011, brin inverseTNPO2TRIR : 12 730 640–12 734 747, brin inverseTRIRGET3 : 12 737 139–12 748 325, brin directGET3BEST2 : 12 751 673–12 758 458, brin directBEST2HOOK2 : 12 762 640–12 872 740, brin inverseHOOK2JUNB : 12 791 486–12 793 315, brin directPRDX2 : 12 796 817–12 801 882, brin inverseTHSD8 : 12 802 031–12 813 581, brin directRNASEH2A : 12 806 505–12 813 644, brin directRNASEH2ARTBDN : 12 825 477–12 838 362, brin inverseRTBDNMAST1 : 12 833 860–12 874 952, brin directMAST1DNASE2 : 12 875 209–12 881 595, brin inverseKLF1 : 12 884 405–12 887 201, brin inverseGCDH : 12 891 128–12 915 261, brin directSYCE2 : 12 898 786–12 919 306, brin inverseFARSA : 12 921 138–12 934 037, brin inverseFARSACALR : 12 938 609–12 944 489, brin directCALRRAD23A : 12 945 716–12 953 646, brin directRAD23AGADD45GIP1 : 12 950 701–12 957 333, brin inverseGADD45GIP1DAND5 : 12 965 159–12 974 760, brin directNFIX : 12 995 401–13 098 796, brin directNFIXLYL1 : 13 099 028–13 103 188, brin inverseLYL1TRMT1 : 13 104 899–13 117 567, brin inverseTRMT1NACC1 : 13 116 468–13 141 147, brin directNACC1STX10 : 13 144 058–13 150 383, brin inverseSTX10IER2 : 13 150 403–13 156 981, brin directIER2CACNA1A : 13 206 442–13 624 489, brin inverseCACNA1ASchéma de CALR : 9 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 9 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 12 938 609–12 938 770, 162 basesExon 2 : 12 939 134–12 939 235, 102 basesExon 3 : 12 939 428–12 939 631, 204 basesExon 4 : 12 940 053–12 940 147, 95 basesExon 5 : 12 940 243–12 940 452, 210 basesExon 6 : 12 940 541–12 940 654, 114 basesExon 7 : 12 940 744–12 940 887, 144 basesExon 8 : 12 943 537–12 943 629, 93 basesExon 9 : 12 943 713–12 944 489, 777 bases1234567895′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,9 kb sur les 5,9 kb du gène ; 1 254 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit CALR

2

positions dans CALR où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 5,9 kb de CALR, introns compris, et pas seulement les 1,9 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène CALR : calreticulin. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. Gène CALR : calreticulin [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/calr

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