Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

CALR

calreticulin

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19p13.13
Koordinaadid
Kromosoom 19: 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Eksonid
9 eksonit, ulatus 5,9 kb
Valk
417 aminohapet
Tuntud ka kui
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
MANE Select transkript
ENST00000316448.10NM_004343.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CALR veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CALR on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub CALR. CALR ja sellele lähedal asuvad 42 geeni kromosoomil 19, vahemikus 12 441 549 kuni 13 441 548.Kromosoom 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12 433 103–12 484 816, pöördne ahelZNF709: 12 461 184–12 513 854, pöördne ahelZNF709: 12 461 559–12 551 474, pöördne ahelZNF564: 12 524 903–12 551 542, pöördne ahelZNF564: 12 525 720–12 580 975, pöördne ahelZNF490: 12 575 832–12 640 098, pöördne ahelZNF490ZNF791: 12 610 916–12 633 840, otsene ahelZNF791MAN2B1: 12 643 831–12 666 762, pöördne ahel: 12 643 831–12 648 397, pöördne ahel: 12 664 828–12 669 397, pöördne ahelWDR83: 12 666 802–12 675 832, otsene ahelWDR83OS: 12 668 065–12 669 467, pöördne ahel: 12 668 071–12 681 834, pöördne ahelDHPS: 12 673 411–12 681 901, pöördne ahelDHPSFBXW9: 12 687 801–12 696 659, pöördne ahelFBXW9GNG14: 12 687 998–12 688 422, otsene ahelGNG14TNPO2: 12 699 111–12 724 011, pöördne ahelTNPO2TRIR: 12 730 640–12 734 747, pöördne ahelTRIRGET3: 12 737 139–12 748 325, otsene ahelGET3BEST2: 12 751 673–12 758 458, otsene ahelBEST2HOOK2: 12 762 640–12 872 740, pöördne ahelHOOK2JUNB: 12 791 486–12 793 315, otsene ahelPRDX2: 12 796 817–12 801 882, pöördne ahelTHSD8: 12 802 031–12 813 581, otsene ahelRNASEH2A: 12 806 505–12 813 644, otsene ahelRNASEH2ARTBDN: 12 825 477–12 838 362, pöördne ahelRTBDNMAST1: 12 833 860–12 874 952, otsene ahelMAST1DNASE2: 12 875 209–12 881 595, pöördne ahelKLF1: 12 884 405–12 887 201, pöördne ahelGCDH: 12 891 128–12 915 261, otsene ahelSYCE2: 12 898 786–12 919 306, pöördne ahelFARSA: 12 921 138–12 934 037, pöördne ahelFARSACALR: 12 938 609–12 944 489, otsene ahelCALRRAD23A: 12 945 716–12 953 646, otsene ahelRAD23AGADD45GIP1: 12 950 701–12 957 333, pöördne ahelGADD45GIP1DAND5: 12 965 159–12 974 760, otsene ahelNFIX: 12 995 401–13 098 796, otsene ahelNFIXLYL1: 13 099 028–13 103 188, pöördne ahelLYL1TRMT1: 13 104 899–13 117 567, pöördne ahelTRMT1NACC1: 13 116 468–13 141 147, otsene ahelNACC1STX10: 13 144 058–13 150 383, pöördne ahelSTX10IER2: 13 150 403–13 156 981, otsene ahelIER2CACNA1A: 13 206 442–13 624 489, pöördne ahelCACNA1ACALR skeem: 9 eksonit kromosoomi 19 otsene ahelalEkson 9: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 1: 12 938 609–12 938 770, 162 alustEkson 2: 12 939 134–12 939 235, 102 alustEkson 3: 12 939 428–12 939 631, 204 alustEkson 4: 12 940 053–12 940 147, 95 alustEkson 5: 12 940 243–12 940 452, 210 alustEkson 6: 12 940 541–12 940 654, 114 alustEkson 7: 12 940 744–12 940 887, 144 alustEkson 8: 12 943 537–12 943 629, 93 alustEkson 9: 12 943 713–12 944 489, 777 alust1234567895′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 5,9 kb; neist 1254 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse CALR

2

kohad geenis CALR, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CALR 5,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CALR geen: calreticulin. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. CALR geen: calreticulin [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/calr

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test