Gen
SLC25A4
solute carrier family 25 member 4
- HGNC 10990↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000151729↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 291↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 4q35.1
- Coördinaten
- Chromosoom 4: 185.143.266–185.150.382 (GRCh38)
- Exons
- 4 exons over 7,1 kb
- Eiwit
- 298 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant Autosomaal recessief
- Ook bekend als
- T1, AAC1
- Eerdere symbolen
- PEO3, PEO2, ANT1
- MANE Select-transcript
- ENST00000281456.11NM_001151.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SLC25A4 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Primaire mitochondriële ziekte
- Progressieve externe oftalmoplegie met deleties in mitochondriaal DNA
Veroorzaakt door varianten in nucleaire genen zoals POLG, TWNK, SLC25A4 en RRM2B, die leiden tot meerdere deleties in mitochondriaal DNA. Dit veroorzaakt hangende oogleden, zwakke oogbewegingen en spierzwakte, meestal op volwassen leeftijd.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Actionability
Weten helpt bij het controleren van oog-, hart- en slikfunctie en bij het vermijden van valproaat bij POLG-ziekte.
- Mitochondriaal DNA-depletiesyndroom
Veroorzaakt door varianten in nucleaire genen zoals POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B en SUCLA2. Deze verminderen de hoeveelheid mitochondriaal DNA en kunnen spier-, lever- of hersenziekte veroorzaken.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Actionability
Weten is direct bruikbaar: valproaat moet bij POLG-ziekte worden vermeden vanwege het risico op fatale leverinsufficiëntie, en bij TK2-deficiëntie bestaat een nucleosidetherapie.
Syndromische en metabole cardiomyopathieën
- Mitochondriaal DNA-depletiesyndroom 12B (cardiomyopathisch type)Autosomaal recessief
Een aandoening veroorzaakt door veranderingen in SLC25A4 die vanaf de zuigelingenleeftijd hypertrofische cardiomyopathie en spierzwakte veroorzaakt.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Mitochondriaal DNA-depletiesyndroom 12A (cardiomyopathisch type)Autosomaal dominant
Een ernstige aandoening veroorzaakt door veranderingen in SLC25A4 die vanaf de geboorte cardiomyopathie, spierzwakte en melkzuuracidose veroorzaakt.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
- Autosomaal recessief
- Er is een veranderde kopie van elke ouder nodig. Met één bent u drager en meestal niet aangedaan. Wanneer beide ouders dragers zijn, heeft elk kind een kans van één op vier om er twee te erven.
Opbouw van SLC25A4
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,4 kb van de 7,1 kb van het gen; 897 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SLC25A4
10
posities in SLC25A4 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 7,1 kb van SLC25A4, inclusief intronen, en niet alleen de 4,4 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 2Deelt 2 aandoeningen
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunitDeelt 2 aandoeningen
- RRM2Bribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2BDeelt 2 aandoeningen
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseDeelt 2 aandoeningen
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Deelt 1 aandoening
- AGKacylglycerol kinaseDeelt 1 aandoening
- DGUOKdeoxyguanosine kinaseDeelt 1 aandoening
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 4Deelt 1 aandoening
- GUK1guanylate kinase 1Deelt 1 aandoening
- LIG3DNA ligase 3Deelt 1 aandoening
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 1Deelt 1 aandoening
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV17Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SLC25A4
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SLC25A4 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Intellectual disability, mild
- Decreased reflex response
- Resting tremor
- Slow movements
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Anxiety
Toon 16 kenmerken meer
- Ataxia
- Decreased muscle movement
- Degeneration of cerebellum
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Epilepsy
- Focal white matter lesions
- Inability to coordinate movements when walking
- Lethargy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Tremor
- Bipolar disorder
- Cognitive impairment
- Migraine
- Inability to walk
Abnormality of the musculoskeletal system
- Cytochrome C oxidase-negative muscle fibers
- EMG: myopathic abnormalities
- Muscle degeneration
- Ragged-red muscle fibers
- Tired easily
- Muscle tissue disease
- Mitochondrial myopathy
- Muscle weakness
Toon 11 kenmerken meer
- Cogwheel rigidity
- Difficulty walking up stairs
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Rigidity
- Muscle spasm
- Osteoporosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Generalized muscle weakness
- Subsarcolemmal accumulations of abnormally shaped mitochondria
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Severe lactic acidosis
- Organic aciduria
- Glucose intolerance
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart murmur
- Left ventricular hypertrophy
- Abnormal heart rate
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular arrhythmia
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SLC25A4-gen: solute carrier family 25 member 4. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/slc25a4
Dante Labs. SLC25A4-gen: solute carrier family 25 member 4 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/slc25a4
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken