Gene
SLC25A4
solute carrier family 25 member 4
- HGNC 10990↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000151729↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 291↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 4q35.1
- Coordinate
- Cromosoma 4: 185.143.266–185.150.382 (GRCh38)
- Esoni
- 4 esoni su 7,1 kb
- Proteina
- 298 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante Autosomica recessiva
- Noto anche come
- T1, AAC1
- Simboli precedenti
- PEO3, PEO2, ANT1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000281456.11NM_001151.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Malattia mitocondriale primaria
- Oftalmoplegia cronica progressiva con delezioni del DNA mitocondriale
Causata da varianti in geni nucleari come POLG, TWNK, SLC25A4 e RRM2B che determinano molteplici delezioni del DNA mitocondriale, provocando ptosi palpebrale, debolezza dei movimenti oculari e debolezza muscolare, di solito in età adulta.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere questa condizione guida il monitoraggio della funzione oculare, cardiaca e della deglutizione e l'evitamento del valproato nella malattia da POLG.
- Sindrome da deplezione del DNA mitocondriale
Causata da varianti in geni nucleari come POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B e SUCLA2, che riducono la quantità di DNA mitocondriale e possono provocare malattie del muscolo, del fegato o del cervello.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere questa condizione ha un'applicazione diretta: il valproato deve essere evitato nella malattia da POLG a causa del rischio di insufficienza epatica fatale, e il deficit di TK2 dispone di una terapia con nucleosidi.
Cardiomiopatie sindromiche e metaboliche
- Sindrome da deplezione del DNA mitocondriale 12B (tipo cardiomiopatico)Autosomica recessiva
Una condizione causata da alterazioni in SLC25A4 che provoca cardiomiopatia ipertrofica e debolezza muscolare fin dalla prima infanzia.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Sindrome da deplezione del DNA mitocondriale 12A (tipo cardiomiopatico)Autosomica dominante
Una grave condizione causata da alterazioni in SLC25A4 che provoca cardiomiopatia, debolezza muscolare e acidosi lattica fin dalla nascita.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di SLC25A4
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 4,4 kb dei 7,1 kb del gene; 897 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SLC25A4
10
posizioni in SLC25A4 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 7,1 kb di SLC25A4, introni inclusi, non solo i 4,4 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 2Condivide 2 condizioni
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunitCondivide 2 condizioni
- RRM2Bribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2BCondivide 2 condizioni
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseCondivide 2 condizioni
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Condivide 1 condizione
- AGKacylglycerol kinaseCondivide 1 condizione
- DGUOKdeoxyguanosine kinaseCondivide 1 condizione
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 4Condivide 1 condizione
- GUK1guanylate kinase 1Condivide 1 condizione
- LIG3DNA ligase 3Condivide 1 condizione
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 1Condivide 1 condizione
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV17Condivide 1 condizione
Tratti collegati a SLC25A4
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLC25A4 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Intellectual disability, mild
- Decreased reflex response
- Resting tremor
- Slow movements
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Anxiety
Mostra altri 16 tratti
- Ataxia
- Decreased muscle movement
- Degeneration of cerebellum
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Epilepsy
- Focal white matter lesions
- Inability to coordinate movements when walking
- Lethargy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Tremor
- Bipolar disorder
- Cognitive impairment
- Migraine
- Inability to walk
Abnormality of the musculoskeletal system
- Cytochrome C oxidase-negative muscle fibers
- EMG: myopathic abnormalities
- Muscle degeneration
- Ragged-red muscle fibers
- Tired easily
- Muscle tissue disease
- Mitochondrial myopathy
- Muscle weakness
Mostra altri 11 tratti
- Cogwheel rigidity
- Difficulty walking up stairs
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Rigidity
- Muscle spasm
- Osteoporosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Generalized muscle weakness
- Subsarcolemmal accumulations of abnormally shaped mitochondria
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Severe lactic acidosis
- Organic aciduria
- Glucose intolerance
Mostra altri 4 tratti
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart murmur
- Left ventricular hypertrophy
- Abnormal heart rate
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular arrhythmia
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SLC25A4: solute carrier family 25 member 4. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc25a4
Dante Labs. Gene SLC25A4: solute carrier family 25 member 4 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc25a4
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