Geen
SLC25A4
solute carrier family 25 member 4
- HGNC 10990↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000151729↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 291↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 4q35.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 4: 185 143 266–185 150 382 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 7,1 kb
- Valk
- 298 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- T1, AAC1
- Varasemad tähised
- PEO3, PEO2, ANT1
- MANE Select transkript
- ENST00000281456.11NM_001151.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SLC25A4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Primaarne mitokondriaalne haigus
- Progresseeruv väline oftalmoplegia mitokondriaalse DNA deletsioonidega
Põhjustavad tuumageenide, näiteks POLG, TWNK, SLC25A4 ja RRM2B variandid, mis viivad mitmete mitokondriaalse DNA deletsioonideni. Tagajärjeks on langenud silmalaud, nõrgad silmaliigutused ja lihasnõrkus, tavaliselt täiskasvanueas.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Teadmine suunab silma-, südame- ja neelamisfunktsiooni jälgimist ning POLG-haiguse korral valproaadi vältimist.
- Mitokondriaalse DNA kadu sündroom
Põhjustavad tuumageenide, näiteks POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B ja SUCLA2 variandid, mis vähendavad mitokondriaalse DNA hulka ning võivad põhjustada lihaste, maksa või aju haigusi.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Teadmine on otseselt kasutatav: POLG-haiguse korral tuleb valproaati vältida surmaga lõppeva maksapuudulikkuse riski tõttu ning TK2 puudulikkuse korral on olemas nukleosiidravi.
Sindroomsed ja metaboolsed kardiomüopaatiad
- Mitokondriaalse DNA kadumise sündroom 12B (kardiomüopaatiline tüüp)Autosoomne retsessiivne
Haigusseisund, mis on põhjustatud SLC25A4 muutustest ning mis põhjustab imikueast alates hüpertroofilist kardiomüopaatiat ja lihasnõrkust.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Mitokondriaalse DNA kadumise sündroom 12A (kardiomüopaatiline tüüp)Autosoomne dominantne
Raske haigusseisund, mis on põhjustatud SLC25A4 muutustest ning mis põhjustab sünnist alates kardiomüopaatiat, lihasnõrkust ja laktaatatsidoosi.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas SLC25A4 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,4 kb kogupikkusega 7,1 kb; neist 897 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SLC25A4
10
kohad geenis SLC25A4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SLC25A4 7,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 2Jagab 2 haigust
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunitJagab 2 haigust
- RRM2Bribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2BJagab 2 haigust
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseJagab 2 haigust
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Jagab 1 haigust
- AGKacylglycerol kinaseJagab 1 haigust
- DGUOKdeoxyguanosine kinaseJagab 1 haigust
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 4Jagab 1 haigust
- GUK1guanylate kinase 1Jagab 1 haigust
- LIG3DNA ligase 3Jagab 1 haigust
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 1Jagab 1 haigust
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV17Jagab 1 haigust
Geeniga SLC25A4 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SLC25A4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Intellectual disability, mild
- Decreased reflex response
- Resting tremor
- Slow movements
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Anxiety
Näita veel 16 tunnust
- Ataxia
- Decreased muscle movement
- Degeneration of cerebellum
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Epilepsy
- Focal white matter lesions
- Inability to coordinate movements when walking
- Lethargy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Tremor
- Bipolar disorder
- Cognitive impairment
- Migraine
- Inability to walk
Abnormality of the musculoskeletal system
- Cytochrome C oxidase-negative muscle fibers
- EMG: myopathic abnormalities
- Muscle degeneration
- Ragged-red muscle fibers
- Tired easily
- Muscle tissue disease
- Mitochondrial myopathy
- Muscle weakness
Näita veel 11 tunnust
- Cogwheel rigidity
- Difficulty walking up stairs
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Rigidity
- Muscle spasm
- Osteoporosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Generalized muscle weakness
- Subsarcolemmal accumulations of abnormally shaped mitochondria
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Severe lactic acidosis
- Organic aciduria
- Glucose intolerance
Näita veel 4 tunnust
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart murmur
- Left ventricular hypertrophy
- Abnormal heart rate
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular arrhythmia
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SLC25A4 geen: solute carrier family 25 member 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc25a4
Dante Labs. SLC25A4 geen: solute carrier family 25 member 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc25a4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast