Gene
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000149311↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 472↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 11q22.3
- Coordinate
- Cromosoma 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Esoni
- 63 esoni su 146 kb
- Proteina
- 3056 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante Autosomica recessiva
- Noto anche come
- TEL1, TELO1
- Simboli precedenti
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Trascritto MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
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Atassia-teleangectasia
- Autosomica recessiva
Atassia cerebellare progressiva, teleangectasia, immunodeficienza e predisposizione al cancro causate da alterazioni bialleliche di ATM.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
La diagnosi orienta la prevenzione delle infezioni e la terapia sostitutiva con immunoglobuline, riducendo l'esposizione alle radiazioni ionizzanti, nonché il monitoraggio oncologico e polmonare e il test di portatore nei familiari.
Infertilità femminile
Ridotta o assente capacità di una donna di concepire.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Geni del seno e dell'ovaio oltre BRCA1/2
- Predisposizione al tumore correlata a ATMAutosomica dominante
Una singola variante in ATM aumenta moderatamente il rischio di tumore del seno ed è associata al tumore del pancreas e della prostata.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Generalmente si raccomanda uno screening mammario potenziato; i portatori il cui partner è anch'esso portatore di una variante in ATM potrebbero voler conoscere il rischio di atassia-teleangectasia nei figli.
- Tumore del seno ereditarioAutosomica dominante
Suscettibilità ereditaria al tumore del seno causata da varianti in uno di diversi geni.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
A seconda del gene, può essere consigliato uno screening mammario anticipato e più intensivo, inclusa la risonanza magnetica.
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di ATM
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 12,9 kb dei 146 kb del gene; 9171 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge ATM
2935
posizioni in ATM in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
11 di esse (0,4%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Low mappability (11 siti)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Un genoma intero copre tutti i 146 kb di ATM, introni inclusi, non solo i 12,9 kb di esoni.
Varianti con una pagina (808)
Le varianti ATM con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Esone 18 | 108.268.501 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| c.2T>C | Esone 2 | 108.227.626 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.332-1G>A | Introne 4 | 108.235.669 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.496+5G>A | Introne 5 | 108.235.839 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.1122_1123del | Esone 9 | 108.248.987 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.1607+1G>T | Introne 10 | 108.251.073 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2251-2A>T | Introne 14 | 108.257.479 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2251-4A>G | Introne 14 | 108.257.477 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2466+5G>C | Introne 16 | 108.259.080 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2639-23_2639-21del | Introne 17 | 108.268.386 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAadenosine deaminaseCondivide 1 condizione
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseCondivide 1 condizione
- AK2adenylate kinase 2Condivide 1 condizione
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Condivide 1 condizione
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BCondivide 1 condizione
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Condivide 1 condizione
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Condivide 1 condizione
- B2Mbeta-2-microglobulinCondivide 1 condizione
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Condivide 1 condizione
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Condivide 1 condizione
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorCondivide 1 condizione
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 1 condizione
Tratti collegati a ATM
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che ATM può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Mostra altri 29 tratti
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Mostra altri 3 tratti
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene ATM: ATM serine/threonine kinase. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/atm
Dante Labs. Gene ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/atm
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