Geen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000149311↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 472↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11q22.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Eksonid
- 63 eksonit, ulatus 146 kb
- Valk
- 3056 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- TEL1, TELO1
- Varasemad tähised
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- MANE Select transkript
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
Loe ATM ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ataksia-telangiektaasia
- Autosoomne retsessiivne
Progresseeruv väikeaju ataksia, telangiektaasia, immuunpuudulikkus ja vähi eelsoodumus, mille põhjustavad ATM-geeni mõlema koopia muutused.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 8 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos suunab infektsioonide ennetamist ja immunoglobuliinasendusravi, aitab vältida ioniseeriva kiirguse mõju, toetab vähi- ja kopsude jälgimist ning sugulaste kandjatestimist.
Naiste viljatus
Naise vähenenud või puuduv võime rasestuda.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 8 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Vähivärsked geenid peale BRCA1/2 rinna- ja munasarjavähi korral
- ATM-ga seotud vähi eelsoodumusAutosoomne dominantne
Üksik ATM variant suurendab mõõdukalt rinnavähi riski ning on seotud kõhunäärme- ja eesnäärmevähiga.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Üldiselt soovitatakse tihendatud rinnanäärme sõeluuringut; kandjad, kelle partneril on samuti ATM variant, võivad soovida teada oma laste riski ataksia-telangiektaasia suhtes.
- Pärilik rinnavähkAutosoomne dominantne
Pärilik eelsoodumus rinnavähile, mis on põhjustatud ühe mitmest geenist variantidest.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Sõltuvalt geenist võidakse soovitada varasemat ja intensiivsemat rinnanäärme sõeluuringut, sealhulgas MRT-uuringut.
Laiemad rühmad
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Immuunpuudulikkushaigus
Üks 170 sellega seotud geenist
Haigus, mille korral on rakulise või humoraalse immuunsuse mehhanismid puudulikud või defektsed.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 8 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
HSCT raske kombineeritud immuunpuudulikkuse (SCID) ja muude raskete PID-ide korral; immunoglobuliini asendusravi (IVIG/SCIG) antikehade puudulikkuse korral; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-i korral; geenravi ADA-SCID-i korral; abatatsept CTLA4/LRBA puudulikkuse korral; profülaktilised antibiootikumid; G-CSF CGD korral
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas ATM on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 12,9 kb kogupikkusega 146 kb; neist 9171 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ATM
2935
kohad geenis ATM, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 11 (0,4%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (11 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ATM 146 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (12,9 kb).
Variandid, millel on leht (808)
Siin on ATM variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Ekson 18 | 108 268 501 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.2T>C | Ekson 2 | 108 227 626 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108 235 669 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108 235 839 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1122_1123del | Ekson 9 | 108 248 987 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108 251 073 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108 257 479 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108 257 477 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108 259 080 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108 268 386 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- ADAadenosine deaminaseJagab 1 haigust
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseJagab 1 haigust
- AK2adenylate kinase 2Jagab 1 haigust
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Jagab 1 haigust
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BJagab 1 haigust
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Jagab 1 haigust
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Jagab 1 haigust
- B2Mbeta-2-microglobulinJagab 1 haigust
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Jagab 1 haigust
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Jagab 1 haigust
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorJagab 1 haigust
- BCL11BBCL11 transcription factor BJagab 1 haigust
Geeniga ATM seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ATM võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Näita veel 29 tunnust
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ATM geen: ATM serine/threonine kinase. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/atm
Dante Labs. ATM geen: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/atm
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast