Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000149311↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 472↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 11q22.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Eksoner
- 63 eksoner over 146 kb
- Protein
- 3 056 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kjent som
- TEL1, TELO1
- Tidligere symboler
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Lokustype
- gene with protein product
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les ATM og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ataksi-telangiektasi
- Autosomal recessiv
Progressiv cerebellar ataksi, telangiektasi, immunsvikt og kreftdisposisjon forårsaket av endringer i begge kopiene av ATM.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 8 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Diagnosen styrer forebygging av infeksjoner og behandling med immunglobulinerstatning, minimering av eksponering for ioniserende stråling, oppfølging for kreft og lunger, samt bærertesting av slektninger.
Infertilitet hos kvinner
Redusert eller fraværende evne hos en kvinne til å bli gravid.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 8 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Gener for bryst- og eggstokkreft utover BRCA1/2
- Kreftpredisposisjon knyttet til ATMAutosomal dominant
En enkelt variant i ATM øker risikoen for brystkreft moderat og er knyttet til kreft i bukspyttkjertelen og prostatakreft.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Utvidet brystkreftscreening anbefales som regel; bærere som har en partner som også bærer en ATM-variant, kan ønske å vite risikoen for ataksi-telangiektasi hos barna sine.
- Arvelig brystkreftAutosomal dominant
Arvelig predisposisjon for brystkreft forårsaket av varianter i ett av flere gener.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Tidligere og mer intensiv brystkreftscreening, inkludert MR, kan anbefales avhengig av genet.
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsviktsykdommer
- Immunsviktsykdom
Ett av 170 gener knyttet til den
Sykdom der det finnes en mangel eller defekt i immunforsvarsmekanismene, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 8 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
HSCT ved SCID og alvorlige PID; immunglobulinerstatning (IVIG/SCIG) ved antistoffmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4- og LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er ATM bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 12,9 kb av genets 146 kb, og 9 171 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test ATM
2 935
posisjoner i ATM der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
11 av dem (0,4 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.
- Low mappability (11 posisjoner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsekvensering dekker alle 146 kb av ATM, inkludert introner, og ikke bare de 12,9 kb med eksoner.
Varianter med egen side (808)
De ATM-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Ekson 18 | 108 268 501 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| c.2T>C | Ekson 2 | 108 227 626 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108 235 669 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108 235 839 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.1122_1123del | Ekson 9 | 108 248 987 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108 251 073 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108 257 479 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108 257 477 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108 259 080 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108 268 386 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ADAadenosine deaminaseDeler 1 tilstand
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeler 1 tilstand
- AK2adenylate kinase 2Deler 1 tilstand
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Deler 1 tilstand
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDeler 1 tilstand
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Deler 1 tilstand
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 tilstand
- B2Mbeta-2-microglobulinDeler 1 tilstand
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Deler 1 tilstand
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Deler 1 tilstand
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeler 1 tilstand
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til ATM
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ATM kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Vis 29 egenskaper til
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ATM-genet: ATM serine/threonine kinase. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/atm
Dante Labs. ATM-genet: ATM serine/threonine kinase [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/atm
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker