Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000149311↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 472↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 11q22.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Exoner
- 63 exoner fordelt over 146 kb
- Protein
- 3.056 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kendt som
- TEL1, TELO1
- Tidligere symboler
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- MANE Select-transkript
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Lokustype
- gene with protein product
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs ATM og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ataxi-telangiectasi
- Autosomal recessiv
Progressiv cerebellar ataxi, telangiectasi, immundefekt og kræftdisposition forårsaget af bialleliske ATM-ændringer.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 8 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Diagnosen vejleder forebyggelse af infektioner og substitutionsbehandling med immunglobuliner, minimering af eksponering for ioniserende stråling, kræft- og lungeovervågning samt bæreranalyse hos pårørende.
Infertilitet hos kvinder
Nedsat eller manglende evne hos en kvinde til at opnå graviditet.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 8 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Brystkræft- og æggestokkræftgener ud over BRCA1/2
- ATM-relateret kræftdispositionAutosomal dominant
En enkelt variant i ATM øger moderat risikoen for brystkræft og er forbundet med bugspytkirtelkræft og prostatakræft.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Forstærket brystscreening anbefales generelt; bærere, hvis partner også bærer en ATM-variant, kan ønske at kende risikoen for ataxia-telangiectasia hos deres børn.
- Arvelig brystkræftAutosomal dominant
Arvelig disposition for brystkræft forårsaget af varianter i et af flere gener.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Tidligere og mere intensiv brystscreening, herunder MR-scanning, kan anbefales afhængigt af genet.
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Immunsvigtsygdom
Et af 170 gener, der er knyttet til det
Sygdom, hvor der er mangel på eller defekt i immunforsvarets mekanismer, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 8 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
HSCT ved SCID og alvorlige PID'er; immunglobulinbehandling (IVIG/SCIG) ved antistofmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4-/LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er ATM opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 12,9 kb af genets 146 kb; 9.171 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest ATM
2.935
positioner i ATM, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
11 af dem (0,4 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (11 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalyse dækker alle 146 kb af ATM, inklusive introner, og ikke kun de 12,9 kb eksoner.
Varianter med en side (808)
Her vises de ATM-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exon 18 | 108.268.501 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| c.2T>C | Exon 2 | 108.227.626 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108.235.669 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108.235.839 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.1122_1123del | Exon 9 | 108.248.987 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108.251.073 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108.257.479 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108.257.477 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108.259.080 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108.268.386 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ADAadenosine deaminaseDeler 1 sygdom
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeler 1 sygdom
- AK2adenylate kinase 2Deler 1 sygdom
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Deler 1 sygdom
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDeler 1 sygdom
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Deler 1 sygdom
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 sygdom
- B2Mbeta-2-microglobulinDeler 1 sygdom
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Deler 1 sygdom
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Deler 1 sygdom
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeler 1 sygdom
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 1 sygdom
Træk knyttet til ATM
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ATM kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Vis 29 træk mere
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Vis 3 træk mere
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ATM-genet: ATM serine/threonine kinase. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/atm
Dante Labs. ATM-genet: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/atm
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger