Geeni
SATB2
SATB homeobox 2
- HGNC 21637↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000119042↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 23314↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q33.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 199 269 505–199 457 939 (GRCh38)
- Eksonit
- 11 eksonia 188,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 733 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA1034, FLJ21474
- MANE Select -transkripti
- ENST00000417098.6NM_001172509.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SATB2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Älyllinen kehitysvammaisuus
Yksi 233 siihen liittyvästä geenistä
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
SATB2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,6 kb geenin 188,4 kb:stä; 2 202 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SATB2
120
SATB2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 188,4 kb geenistä SATB2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Yhteinen sairaus: 1
- ADKadenosine kinaseYhteinen sairaus: 1
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxYhteinen sairaus: 1
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Yhteinen sairaus: 1
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Yhteinen sairaus: 1
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- ANK3ankyrin 3Yhteinen sairaus: 1
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Yhteinen sairaus: 1
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Yhteinen sairaus: 1
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Yhteinen sairaus: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Yhteinen sairaus: 1
- ARID1AAT-rich interaction domain 1AYhteinen sairaus: 1
Geeniin SATB2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SATB2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Cleft palate
- Decreased facial muscle tone
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Gum enlargement
- Little lower jaw
Näytä 42 piirrettä lisää
- Long eyelashes
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Pierre-Robin sequence
- Abnormal dentition
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Decreased volume of lip
- Drooling
- Facial asymmetry
- High forehead
- High palate
- Prominent forehead
- Prominent nasal bridge
- Smooth philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Abnormality of the red part of the upper lip
- Absence of adult teeth
- Bad bite
- Beaked nose
- Bifid uvula
- Big calvaria
- Broad head shape
- Dacryocystitis
- Decreased size of tooth
- Failure of development of more than six teeth
- Flat back of skull
- Frontal bossing
- Long face
- Narrow face
- Narrow mouth
- Relatively large head
- Short neck
- Short nose
- Short philtrum
- Wide nose
- Bulbous nose
- Cone shaped tooth
- Long nose
- Midface retrusion
- Narrow nose
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Frequent temper tantrums
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Happy demeanor
- Restlessness
Näytä 26 piirrettä lisää
- Absent speech development
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed myelination
- IQ between 34 and 49
- Severe global developmental delay
- Anxiety
- Autism
- Can't control feelings
- Conspicuously happy disposition
- Epilepsy
- Incomprehensible speech
- Increased appetite
- Morphological central nervous system abnormality
- Obstructive sleep apnea
- Poor speech
- Self-mutilation
- Typical absence seizure
- Wide based walk
- More active than typical
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SATB2-geeni: SATB homeobox 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/satb2
Dante Labs. SATB2-geeni: SATB homeobox 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/satb2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa