Geeni
NEB
nebulin
- HGNC 7720↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000183091↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4703↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q23.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 151 485 339–151 734 476 (GRCh38)
- Eksonit
- 182 eksonia 249,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 8 525 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- NEB177D
- Aiemmat symbolit
- NEM2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000397345.8NM_001164508.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue NEB ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Synnynnäiset myopatiat
- Nemaliinimyopatia
Synnynnäinen myopatia, jolle on ominaista lihassyissä esiintyvät sauvamaiset rakenteet. Sitä aiheuttavat useimmiten NEB- tai ACTA1-variantit.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
NEB-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 26,2 kb geenin 249,1 kb:stä; 25 578 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä NEB
1 802
NEB-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 187 (10 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (187 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (154 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 249,1 kb geenistä NEB, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 26,2 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (9)
Tässä ovat NEB-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.78+1G>A | Introni 4 | 151 729 614 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.6076-1G>T | Introni 47 | 151 658 091 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.11910+1G>A | Introni 79 | 151 610 761 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.19944G>A | Eksoni 129 | 151 551 738 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| D498G | c.1493A>G | Eksoni 17 | 151 696 713 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R2313X | c.6937C>T | Eksoni 53 | 151 650 864 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R7997X | c.23989C>T | Eksoni 168 | 151 501 423 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| S6366I | c.19097G>T | Eksoni 122 | 151 561 212 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| T7382P | c.22144A>C | Eksoni 150 | 151 525 975 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACTA1actin alpha 1, skeletal muscleYhteinen sairaus: 1
- CFL2cofilin 2Yhteinen sairaus: 1
- KBTBD13kelch repeat and BTB domain containing 13Yhteinen sairaus: 1
- KLHL40kelch like family member 40Yhteinen sairaus: 1
- KLHL41kelch like family member 41Yhteinen sairaus: 1
- LMOD3leiomodin 3Yhteinen sairaus: 1
- MYPNmyopalladinYhteinen sairaus: 1
- SELENONselenoprotein NYhteinen sairaus: 1
- TNNT1troponin T1, slow skeletal typeYhteinen sairaus: 1
- TPM2tropomyosin 2Yhteinen sairaus: 1
- TPM3tropomyosin 3Yhteinen sairaus: 1
Geeniin NEB liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NEB voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Arthrogryposis multiplex congenita
- EMG: myopathic abnormalities
- Generalized muscle weakness
- Muscle tissue disease
- Severely decreased muscle tone
- Abnormality of the chest
- Axial muscle weakness
- Fatigable weakness of distal limb muscles
Näytä 38 piirrettä lisää
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle wasting
- Increased connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Multiple fractures present at birth
- Muscle degeneration
- Muscle stiffness
- Neck flexion weakness
- Progressive distal muscle weakness
- Reduced spine movement
- Sternocleidomastoid amyotrophy
- Type 1 muscle fiber predominance
- Abnormality of the diaphragm
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatiguable weakness of proximal limb muscles
- Frequent falls
- Funnel chest
- Generalized decreased muscle tone
- Muscle fiber splitting
- Narrow chest
- Neck muscle weakness
- Progressive proximal muscle weakness
- Prominent swayback
- Rimmed vacuoles
- Scoliosis
- Thin ribs
- Tired easily
- Hunched back
- Abnormality of the rib cage
- Bulbar palsy
- Congenital contracture
- EMG: neuropathic changes
- Late-onset distal muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
Abnormality of head or neck
- Weakness of facial musculature
- Bell's palsy
- High palate
- Myopathic facies
- Narrow mouth
- Facial diplegia
- High, narrow palate
- Little lower jaw
Näytä 6 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NEB-geeni: nebulin. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/neb
Dante Labs. NEB-geeni: nebulin [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/neb
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa