Geeni
GMPPB
GDP-mannose pyrophosphorylase B
- HGNC 22932↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000173540↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 29925↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3p21.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 49 719 916–49 723 951 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 4 kb:n alueella
- Proteiini
- 360 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA1851
- MANE Select -transkripti
- ENST00000308388.7NM_021971.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue GMPPB ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Synnynnäiset lihasdystrofiat
- Synnynnäinen lihasdystrofia
Lihasdystrofioiden ryhmä, jonka oireet alkavat syntymässä tai imeväisiässä. Ryhmään kuuluvat myös dystroglykanopatiat (kuten FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-liitännäiset muodot).
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Synnynnäinen myasteeninen oireyhtymä
- Synnynnäinen myasteeninen oireyhtymä (kaikki tyypit)
Yläkäsite, joka kattaa kaikki synnynnäiset myasteeniset oireyhtymät, mukaan lukien yleiset CHRNE-, RAPSN-, DOK7- ja MUSK-muodot.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Monet muodot reagoivat tiettyihin lääkkeisiin, kuten pyridostigmiiniin, salbutamoliin tai efedriiniin, ja sopiva valinta riippuu kyseessä olevasta geenistä.
Synnynnäiset glykosylaatiohäiriöt
- Alfa-dystroglykaanipatiatAutosomaalinen resessiivinen
Lihassairauksia, joiden taustalla on virheellinen sokerin kiinnittyminen alfa-dystroglykaaniin (O-mannosylaatio). Oireet vaihtelevat vakavasta synnynnäisestä lihasdystrofiasta, johon liittyy aivojen ja silmien osallisuus, lievään raajavyöhykkeen heikkouteen. Aihetta käsitellään tarkemmin myös synnynnäisten lihasdystrofioiden raportissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Synnynnäiset glykosylaatiohäiriöt (CDG)
Yksi 98 siihen liittyvästä geenistä
Laaja joukko perinnöllisiä sairauksia, joissa sokeriketjuja (glykaaneja) ei rakenneta tai kiinnitetä oikein proteiineihin ja rasvoihin. Ne vaikuttavat usein aivoihin, maksaan, veren hyytymiseen, kasvuun ja moniin muihin elimistön järjestelmiin. Useimmat periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, mutta osa on X-kromosomaalisia tai autosomaalisesti dominantteja.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Raajalihasdystrofia (Limb-Girdle)
- Raajavyöhykkeen lihasdystrofia
Raajavyöhykkeen lihasdystrofialla tarkoitetaan useita alatyyppejä, joilla on erilaiset periytymismallit (ja myös diagnoosin varmuus vaihtelee). Taudin kanssa yhteydessä olevia variantteja kantavien kannattaa hakeutua lihas- ja luustoerikoislääkärin arvioon varmistavaa diagnoosia varten.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
GMPPB-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,1 kb geenin 4 kb:stä; 1 083 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä GMPPB
50
GMPPB-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 4 kb geenistä GMPPB, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- DAG1dystroglycan 1Yhteisiä sairauksia: 4
- FKRPfukutin related proteinYhteisiä sairauksia: 4
- FKTNfukutinYhteisiä sairauksia: 4
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AYhteisiä sairauksia: 3
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Yhteisiä sairauksia: 3
- POMT1protein O-mannosyltransferase 1Yhteisiä sairauksia: 3
- POMT2protein O-mannosyltransferase 2Yhteisiä sairauksia: 3
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitYhteisiä sairauksia: 2
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseYhteisiä sairauksia: 2
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainYhteisiä sairauksia: 2
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainYhteisiä sairauksia: 2
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin GMPPB liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita GMPPB voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Abnormal peripheral nervous system synaptic transmission
- Abnormal pyramidal sign
Näytä 45 piirrettä lisää
- Abnormal shape of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of movement
- Abnormality of the cerebellum
- Absent reflexes
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Diffuse white matter abnormalities
- Dilated fourth ventricle
- Epilepsy
- Favorable response of weakness to acetylcholine esterase inhibitors
- Global developmental delay
- Gray matter heterotopia
- Intellectual disability, mild
- Motor delay
- Poor gross motor coordination
- Small brainstem
- Small cerebellum
- Type II lissencephaly
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pons morphology
- Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Absent/small cerebellum
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Cerebellar cyst
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Clonus
- Decreased thalamic volume
- Diminished deep tendon reflex
- Fusion of the cerebellar hemispheres
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Loss of ability to walk
- Meningocele
- More grooves in brain
- Olivopontocerebellar hypoplasia
- Paralysis or weakness of one side of body
- Poor speech
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Waddling gait
Abnormality of the musculoskeletal system
- Hypoglycosylation of alpha-dystroglycan
- Muscle weakness
- Decreased muscle tone in infant
- EMG abnormality
- Muscle tissue disease
- Muscular dystrophy
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Difficulty walking up stairs
Näytä 31 piirrettä lisää
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Excessive inward curvature of lower spine
- Fatigable weakness
- Fatigable weakness of skeletal muscles
- Generalized decreased muscle tone
- Increased jitter at single fiber EMG
- Increased skeletal muscle cells
- Low muscle tone
- Multiple joint contractures
- Poor head control
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormality of connective tissue
- Axial muscle weakness
- Difficulty running
- Double-Jointed
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Flexed joint that cannot be straightened
- Frequent falls
- Gowers sign
- Limited neck movement
- Muscle spasm
- Neck muscle weakness
- Neuropathic spinal arthropathy
- Ragged-red muscle fibers
- Scoliosis
- Tired easily
- Type 1 muscle fiber predominance
- Weakness of outermost muscles
- Generalized muscle wasting
- Joint contracture
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). GMPPB-geeni: GDP-mannose pyrophosphorylase B. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gmppb
Dante Labs. GMPPB-geeni: GDP-mannose pyrophosphorylase B [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gmppb
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa