Geen
GMPPB
GDP-mannose pyrophosphorylase B
- HGNC 22932↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000173540↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 29925↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3p21.31
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 49 719 916–49 723 951 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 4 kb
- Valk
- 360 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- KIAA1851
- MANE Select transkript
- ENST00000308388.7NM_021971.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe GMPPB ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Kaasasündinud lihasdüstroofiad
- Kaasasündinud lihasdüstroofia
Lihasdüstroofiate rühm, mis avaldub sünnil või imikueas, sealhulgas düstroglükanopaatiad (nt FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-seotud vormid).
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kongenitaalne müasteeniline sündroom
- Kaasasündinud müasteenilised sündroomid (kõik tüübid)
Üldmõiste, mis hõlmab kõiki kaasasündinud müasteenilisi sündroome, sealhulgas levinumaid CHRNE, RAPSN, DOK7 ja MUSK vorme.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Paljud vormid reageerivad konkreetsetele ravimitele, nagu püridostigmiin, salbutamool või efedriin, ning sobiv valik sõltub asjaomasest geenist.
Glükosüleerimise kaasasündinud häired
- Alfa-düstroglükaanipaatiadAutosoomne retsessiivne
Lihashaigused, mis tekivad alfa-düstroglükaanile suhkru kinnitumise (O-mannosülatsiooni) häirete tõttu; need ulatuvad raske kaasasündinud lihasdüstroofiani koos aju- ja silmakahjustustega kuni kergema vöötme piirkonna nõrkuseni. Neist räägitakse põhjalikumalt ka aruandes Kaasasündinud lihasdüstroofiad.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Glükosüleerimise kaasasündinud häired (CDG)
Üks 98 sellega seotud geenist
Suur rühm pärilikke haigusi, mille puhul suhkruahelad (glükaanid) ei moodustu ega kinnitu valkudele ja lipiididele õigesti; need mõjutavad sageli aju, maksa, vere hüübimist, kasvu ja paljusid teisi elundisüsteeme. Enamik neist on autosomaalselt retsessiivse pärilikkusega, kuid osa on X-seotud või autosomaalselt dominantse pärilikkusega.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Vöölihaste lihasdüstroofia
Vöölihaste lihasdüstroofia on mitme alatüübi kogum, mille pärilikkuse mustrid on erinevad (ka diagnoosi kindlaksmääramise piisavus on erinev). Selle haigusega seotud variantide kandjad peaksid kindla diagnoosi saamiseks pöörduma lihas-skeleti haiguste spetsialisti poole.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas GMPPB on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,1 kb kogupikkusega 4 kb; neist 1083 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse GMPPB
50
kohad geenis GMPPB, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni GMPPB 4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,1 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- DAG1dystroglycan 1Jagab 4 haigust
- FKRPfukutin related proteinJagab 4 haigust
- FKTNfukutinJagab 4 haigust
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AJagab 3 haigust
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Jagab 3 haigust
- POMT1protein O-mannosyltransferase 1Jagab 3 haigust
- POMT2protein O-mannosyltransferase 2Jagab 3 haigust
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 2 haigust
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseJagab 2 haigust
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainJagab 2 haigust
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainJagab 2 haigust
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainJagab 2 haigust
Geeniga GMPPB seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida GMPPB võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Abnormal peripheral nervous system synaptic transmission
- Abnormal pyramidal sign
Näita veel 45 tunnust
- Abnormal shape of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of movement
- Abnormality of the cerebellum
- Absent reflexes
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Diffuse white matter abnormalities
- Dilated fourth ventricle
- Epilepsy
- Favorable response of weakness to acetylcholine esterase inhibitors
- Global developmental delay
- Gray matter heterotopia
- Intellectual disability, mild
- Motor delay
- Poor gross motor coordination
- Small brainstem
- Small cerebellum
- Type II lissencephaly
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pons morphology
- Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Absent/small cerebellum
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Cerebellar cyst
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Clonus
- Decreased thalamic volume
- Diminished deep tendon reflex
- Fusion of the cerebellar hemispheres
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Loss of ability to walk
- Meningocele
- More grooves in brain
- Olivopontocerebellar hypoplasia
- Paralysis or weakness of one side of body
- Poor speech
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Waddling gait
Abnormality of the musculoskeletal system
- Hypoglycosylation of alpha-dystroglycan
- Muscle weakness
- Decreased muscle tone in infant
- EMG abnormality
- Muscle tissue disease
- Muscular dystrophy
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Difficulty walking up stairs
Näita veel 31 tunnust
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Excessive inward curvature of lower spine
- Fatigable weakness
- Fatigable weakness of skeletal muscles
- Generalized decreased muscle tone
- Increased jitter at single fiber EMG
- Increased skeletal muscle cells
- Low muscle tone
- Multiple joint contractures
- Poor head control
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormality of connective tissue
- Axial muscle weakness
- Difficulty running
- Double-Jointed
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Flexed joint that cannot be straightened
- Frequent falls
- Gowers sign
- Limited neck movement
- Muscle spasm
- Neck muscle weakness
- Neuropathic spinal arthropathy
- Ragged-red muscle fibers
- Scoliosis
- Tired easily
- Type 1 muscle fiber predominance
- Weakness of outermost muscles
- Generalized muscle wasting
- Joint contracture
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). GMPPB geen: GDP-mannose pyrophosphorylase B. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gmppb
Dante Labs. GMPPB geen: GDP-mannose pyrophosphorylase B [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gmppb
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast