Gen
COL6A3
collagen type VI alpha 3 chain
- HGNC 2213↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000163359↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1293↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2q37.3
- Koordinater
- Kromosom 2: 237 324 018–237 414 164 (GRCh38)
- Exoner
- 44 exoner på 90,1 kb
- Protein
- 3 177 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- MANE Select-transkript
- ENST00000295550.9NM_004369.4
- Lokustyp
- gene with protein product
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs COL6A3, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Medfödda muskeldystrofier
- Kollagen VI-relaterad myopati
Ett spektrum av muskelsjukdomar orsakade av varianter i COL6A1, COL6A2 eller COL6A3, från svår medfödd muskeldystrofi av Ullrich-typ till mildare Bethlem-myopati, med svaghet och ledkontrakturer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- Medfödd muskeldystrofi
En grupp muskeldystrofier med debut vid födseln eller under spädbarnsåldern, inklusive dystroglykanopatier (såsom former relaterade till FKRP, FKTN och POMT1/2).
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Dystoni, myotoni, paroxysmal dyskinesi
- Dystoni 27Autosomalt recessiv
Varje dystonisk sjukdom där sjukdomens orsak är en mutation i genen COL6A3.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- Ärftlig dystoni
Samlingsbegrepp för ärftliga dystonier, inklusive DYT-TOR1A, generaliserad dystoni med tidig debut, DYT-THAP1, myoklonus-dystoni (SGCE) och KMT2B-relaterad dystoni.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Muskeldystrofi av typen Limb-Girdle
Muskeldystrofi av typen Limb-girdle definieras som en samling av många undertyper med olika nedärvningsmönster (där möjligheten att ställa diagnos också varierar). Du som är bärare av varianter kopplade till sjukdomen bör vända dig till en specialist inom muskel- och skelettsjukdomar för en säker diagnos.
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är COL6A3 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 10,5 kb av genens 90,1 kb, och 9 534 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest COL6A3
150
positioner i COL6A3 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 90,1 kb av COL6A3, med introner inräknade, inte bara de 10,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDelar 3 tillstånd
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainDelar 3 tillstånd
- DAG1dystroglycan 1Delar 2 tillstånd
- FKRPfukutin related proteinDelar 2 tillstånd
- FKTNfukutinDelar 2 tillstånd
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDelar 2 tillstånd
- LAMA2laminin subunit alpha 2Delar 2 tillstånd
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Delar 2 tillstånd
- SNUPNsnurportin 1Delar 2 tillstånd
- ACTBactin betaDelar 1 tillstånd
- ANO3anoctamin 3Delar 1 tillstånd
- ANO5anoctamin 5Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till COL6A3
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som COL6A3 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal joint hypermobility
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Neck flexion weakness
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
Visa ytterligare 25 egenskaper
- Hunched back
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Increased wrist mobility
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Reduced spine movement
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Joint contracture
- Kyphoscoliosis
- Multiple joint contractures
- Neck muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Axial muscle weakness
- Double-Jointed
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
Abnormality of limbs
- Hip contracture
- Pelvic girdle muscle weakness
- Weak shoulder muscles
- Ankle contracture
- Increased laxity of fingers
- Knee contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
Visa ytterligare 16 egenskaper
- Hip dislocation
- Inability to straighten knee
- Interphalangeal joint contracture of finger
- Inward turned thumb
- Limb-girdle muscle weakness
- Long toe
- Permanent flexion of the finger
- Pes valgus
- Quadriceps weakness
- Slender finger
- Wrist flexion contracture
- Curved toe bone
- Dislocated hip since birth
- Foot drop
- Shortening of the achilles tendon
- Winged shoulder blade
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Laryngeal dystonia
- Oromandibular dystonia
- Writer's cramp
- Abnormal gait
- Action tremor
- Axial dystonia
- Focal dystonia
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). COL6A3-genen: collagen type VI alpha 3 chain. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/col6a3
Dante Labs. COL6A3-genen: collagen type VI alpha 3 chain [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/col6a3
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor