Geen
DSP
desmoplakin
- HGNC 3052↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000096696↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1832↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 6p24.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 6: 7 541 671–7 586 714 (GRCh38)
- Eksonid
- 24 eksonit, ulatus 45 kb
- Valk
- 2871 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- KPPS2, PPKS2, DPI, DPII, DP
- MANE Select transkript
- ENST00000379802.8NM_004415.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe DSP ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Aritmogeenne kardiomüopaatia
- Dilateeriv kardiomüopaatia lokkis juuste, keratodermia ja hambaanomaaliategaAutosoomne dominantne
Seisund, mida põhjustavad muutused geenis DSP ja mis ühendab dilateeriva kardiomüopaatia lokkis juuste, paksenenud nahaga kätel ja jalataldadel ning puuduvate hammastega.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Selle teadmine toetab regulaarset südame jälgimist ja rütmihäirete hindamist.
- Kardioektodermaalsed sündroomid (Naxose tõbi ja Carvajali sündroom)
Seisund, mida põhjustavad muutused geenides JUP või DSP, sealhulgas Naxose tõbi ja Carvajali sündroom, mis ühendavad aritmogeense kardiomüopaatia lokkis juuste ja paksenenud naha ning kätel ja jalataldadel.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Selle teadmine toetab regulaarset südame jälgimist ja rütmihäirete hindamist.
- Aritmogeenne parema vatsakese kardiomüopaatia (ARVC)
Südamelihase progresseeruv asendumine rasv- ja armkoega, peamiselt parempoolses vatsakeses, mis põhjustab vatsakeste aritmiaid; tavaliselt on põhjuseks variandid desmosoomi geenides PKP2, DSP, DSG2, DSC2 ja JUP või geenides TMEM43, PLN või DES.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Diagnoos toetab regulaarset rütmi jälgimist, nõuandeid vastupidavusalaste koormuste piiramise kohta, otsuseid siirdatava defibrillaatori kohta ning sugulaste testimist.
Epidermolysis bullosa
- Päriliku epidermolysis bullosa
Kõik päritud nahahaavandumisega (villidega) nahakahjustuste vormid, sealhulgas simplex-, junktsionaalne ja düstroofne epidermolysis bullosa ning Kindleri sündroom.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Retsessiivsete düstroofsete vormide korral on vajalik regulaarne nahavähi jälgimine ning düstroofse EB korral on nüüd saadaval geenipõhine haavaravi.
Erbelised palmoplantaarsed keratodermiad ja pachyonychia congenita
- Erbelised palmoplantaarne keratoderma
Peopesade ja jalatallade pärilik paksenemine, sealhulgas pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima tüüpi ja Bothnia keratodermad, keratiit-ihtüoos-kurtuse sündroom ning CTSC-ga seotud Papillon-Lefèvre'i ja Haim-Munki sündroom.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos suunab jalgade hooldust ja valu ravi; CTSC-ga seotud vormide puhul kaitseb varajane hambaravi hambaid ning GJB2-ga seotud vormide puhul on soovitatav kuulmise kontroll.
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas DSP on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 9,7 kb kogupikkusega 45 kb; neist 8616 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse DSP
642
kohad geenis DSP, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni DSP 45 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,7 kb).
Variandid, millel on leht (78)
Siin on DSP variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.170+1G>A | Intron 1 | 7 542 086 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.273+1G>A | Intron 2 | 7 555 821 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.939+1G>A | Intron 7 | 7 565 521 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.1574+1G>A | Intron 12 | 7 569 341 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.2130+1G>A | Intron 15 | 7 572 069 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.2298-2A>C | Intron 16 | 7 574 655 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.2436+2T>C | Intron 17 | 7 574 797 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.2437-1G>C | Intron 17 | 7 575 294 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| C2656Wfs*24 | c.7968_7972del | Ekson 24 | 7 585 228 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| D1248Kfs*7 | c.3735_3741dup | Ekson 23 | 7 579 922 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- JUPjunction plakoglobinJagab 3 haigust
- KRT14keratin 14Jagab 2 haigust
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinJagab 1 haigust
- AP1B1adaptor related protein complex 1 subunit beta 1Jagab 1 haigust
- AQP5aquaporin 5Jagab 1 haigust
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Jagab 1 haigust
- CDH2cadherin 2Jagab 1 haigust
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL7A1collagen type VII alpha 1 chainJagab 1 haigust
- CTSCcathepsin CJagab 1 haigust
- DESdesminJagab 1 haigust
- DSC2desmocollin 2Jagab 1 haigust
Geeniga DSP seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida DSP võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Absence of part of skin at birth
- Absent fingernail
- Absent nails
- Acantholysis
- Afro-textured hair
- Alopecia totalis
- Alopecia universalis
Näita veel 20 tunnust
- Fragile skin
- Hyperkeratosis
- Skin erosion
- Thickening of upper layer of skin
- Abnormal dermoepidermal hemidesmosome morphology
- Abnormal dermoepidermal junction morphology
- Abnormality of the hair
- Abnormality of the nail
- Absent hair
- Absent toenail
- Congenital alopecia totalis
- Hair loss
- Palmoplantar scaling skin
- Persistent blue color of hands or feet
- Poor nail formation
- Brittle nails
- Ichthyosis
- Itching
- White discoloration of nails
- Parakeratosis
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). DSP geen: desmoplakin. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/dsp
Dante Labs. DSP geen: desmoplakin [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/dsp
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast