Γονίδιο
SMPD1
sphingomyelin phosphodiesterase 1
- HGNC 11120↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000166311↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 6609↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 11p15.4
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 11: 6.390.474–6.394.996 (GRCh38)
- Εξόνια
- 6 έξώνια σε 4,5 kb
- Πρωτεΐνη
- 631 αμινοξέα
- Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
- Γνωστό επίσης ως
- ASM
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000342245.9NM_000543.5
- Τύπος locus
- gene with protein product
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Γονιδίωμα αναφοράςGRCh38hg38
Οι θέσεις στις σελίδες γονιδίων και παραλλαγών ακολουθούν αυτή την επιλογή, σε αυτό το πρόγραμμα περιήγησης.
Διαβάστε το SMPD1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Όξινη σφιγγομυελινάση, έλλειψη (νόσος Niemann-Pick τύπων A και B)
- Νόσος Niemann-Pick τύπου A (βρεφική νευροσπλαγχνική ASMD)Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Μεγέθυνση ήπατος και σπληνός στη βρεφική ηλικία, με δυσκολίες σίτισης και ταχεία νευρολογική επιδείνωση, που οφείλεται σε σχεδόν πλήρη απώλεια της όξινης σφιγγομυελινάσης.
- 3 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
- Νόσος Niemann-Pick τύπου B (χρόνια σπλαγχνική ASMD)Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Μεγέθυνση ήπατος και σπληνός, χαμηλά αιμοπετάλια, παθολογικά λιπίδια αίματος και διάμεση πνευμονοπάθεια που εμφανίζονται στην παιδική ηλικία ή στην ενήλικη ζωή, συνήθως χωρίς εμπλοκή του εγκεφάλου.
- 3 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Τι αλλάζει με τη γνώση
Η θεραπεία ενζυμικής υποκατάστασης (ολιπουδάση άλφα) αντιμετωπίζει τα μη νευρολογικά συμπτώματα της ASMD.
- Έλλειψη όξινης σφιγγομυελινάσης, άλλες μορφέςΑυτοσωμικός υπολειπόμενος
Περιλαμβάνει την ενδιάμεση χρόνια νευροσπλαγχνική μορφή, με χαρακτηριστικά ανάμεσα στους τύπους A και B.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 6 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Ευρύτερες ομάδες
Λυσοσωμική αποθησαυριστική νόσος
- Λυσοσωμική αποθησαυριστική νόσος (άλλοι και μη προσδιορισμένοι τύποι)
Ένα από τα 59 γονίδια που συνδέονται με αυτό
Καλύπτει λυσοσωμικές αποθησαυριστικές νόσους χωρίς ειδική αναφορά, όπως η νόσος Farber και άλλες διαταραχές που σχετίζονται με το ASAH1, ελλείψεις προσαπσίνης (PSAP), πολλαπλή ελλειψη σουλφατάσης, μουκοπολυσακχαριδώσεις τύπων IX και X, και η νόσος Dorfman-Chanarin· ο τρόπος κληρονομικότητας διαφέρει ανάλογα με τον υποτύπο, συχνότερα αυτοσωμικός υπολειπόμενος.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 7 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
- Απαιτείται ένα μεταλλαγμένο αντίγραφο από κάθε γονέα. Με ένα μόνο, είστε φορέας και συνήθως δεν επηρεάζεστε· όταν και οι δύο γονείς είναι φορείς, κάθε παιδί έχει πιθανότητα ένα προς τέσσερα να κληρονομήσει δύο.
Πώς είναι διαταγμένο το SMPD1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 2,4 kb από τα 4,5 kb του γονιδίου· 1.896 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Πώς διαβάζει ένα τεστ γονιδιώματος το SMPD1
349
θέσεις στο SMPD1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολη.
Η ολόκληρη γονιδιωματική ανάλυση καλύπτει και τα 4,5 kb του SMPD1, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 2,4 kb των εξονίων.
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- AGAaspartylglucosaminidaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- ARSAarylsulfatase AΜοιράζεται 1 πάθηση
- ARSBarylsulfatase BΜοιράζεται 1 πάθηση
- ARSKarylsulfatase family member KΜοιράζεται 1 πάθηση
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Μοιράζεται 1 πάθηση
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninΜοιράζεται 1 πάθηση
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinΜοιράζεται 1 πάθηση
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinΜοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το SMPD1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το SMPD1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Ataxia
- Developmental stagnation
- Mental deterioration
Εμφάνιση 22 ακόμη χαρακτηριστικών
- Motor delay
- Worsening neurological symptoms
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of the nervous system
- Delayed motor skills
- Dementia
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Neurodevelopmental delay
- Peripheral neuropathy
- Abnormality of the cerebellum
- Apraxia
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Bipolar disorder
- Brief seizures with staring spells
- Depression
- Specific learning disability
- Decreased reflex response
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
Laboratory abnormality
- Decreased acid sphingomyelinase activity
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Decreased circulating high-density lipoprotein cholesterol
- Elevated tissue sphingomyelin concentration
- High liver enzymes
- Increased plasma triglycerides
- Abnormal circulating lipid concentration
Εμφάνιση 3 ακόμη χαρακτηριστικών
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormality of the coagulation cascade
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Acute promyelocytic leukemia
- Autoimmune thrombocytopenia
- Bleeding tendency
- Bone-marrow foam cells
- Microcytic anemia
Εμφάνιση 1 ακόμη χαρακτηριστικού
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle degeneration
- Delayed bone maturation
- Low muscle tone
- Osteopenia
- Osteoporosis
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spontaneous fracture
- Muscle weakness
Εμφάνιση 1 ακόμη χαρακτηριστικού
Abnormality of the respiratory system
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Abnormal blood gas level
- Decreased DLCO
- Interstitial pneumonitis
- Progressive pulmonary function impairment
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Breathing difficulty
Εμφάνιση 1 ακόμη χαρακτηριστικού
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται τα στοιχεία
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από το NCBI και το EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνια και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-16: ποιες παθήσεις σχετίζονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι η σχέση.
- Ο κατάλογος δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο και περιοχές που δυσκολεύουν τις αναγνώσεις μικρού μήκους.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.16-c6eea6bf.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο SMPD1: sphingomyelin phosphodiesterase 1. Ανάκτηση 17 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/smpd1
Dante Labs. Γονίδιο SMPD1: sphingomyelin phosphodiesterase 1 [Internet]. [ανακτήθηκε 17 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/smpd1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες