Gen
SMPD1
sphingomyelin phosphodiesterase 1
- HGNC 11120↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000166311↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 6609↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 11p15.4
- Koordinatlar
- Kromozom 11: 6.390.474–6.394.996 (GRCh38)
- Eksonlar
- 4,5 kb boyunca 6 ekson
- Protein
- 631 amino asit
- Kalıtım
- Otozomal resesif
- Diğer adları
- ASM
- MANE Select transkripti
- ENST00000342245.9NM_000543.5
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
SMPD1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Asit Sfingomiyelinaz Eksikliği (Niemann-Pick Hastalığı Tip A ve B)
- Niemann-Pick hastalığı tip A (bebeklik çağında nöronörovisseral ASMD)Otozomal resesif
Asit sfingomiyelinazın neredeyse tamamen kaybıyla oluşan, bebeklikte karaciğer ve dalakta büyüme, beslenme sorunları ve hızlı nörolojik gerileme ile seyreden durum.
- 3 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
- Niemann-Pick hastalığı tip B (kronik viseral ASMD)Otozomal resesif
Çocukluk veya yetişkinlik döneminde başlayan, genellikle beyni tutmayan; karaciğer ve dalak büyümesi, düşük trombosit, anormal kan lipidleri ve интерstisyel akciğer hastalığı ile seyreden durum.
- 3 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Bilmenin neleri değiştirdiği
Enzim replasman tedavisi (olipudaz alfa), ASMD'nin nörolojik olmayan bulgularını tedavi eder.
- Asit sfingomiyelinaz eksikliği, diğer formlarOtozomal resesif
Tip A ile tip B arasında özellikler gösteren, ara kronik nöronörovisseral formu içerir.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 6 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Daha geniş gruplar
Lizozomal Depo Hastalığı
- Lizozomal depo hastalığı (diğer ve belirtilmemiş tipler)
Buna bağlı 59 gen arasından biri
Farber hastalığı ve diğer ASAH1 ilişkili bozukluklar, prosaposin (PSAP) eksiklikleri, çoklu sülfataz eksikliği, mukopolisakkaridoz tip IX ve X ile Dorfman-Chanarin hastalığı gibi, kendine özgü raporu bulunmayan lizozomal depo hastalıklarını kapsar; kalıtım alt tipe göre değişir ve çoğunlukla otozomal resesiftir.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 7 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Kalıtım
- Otozomal resesif
- Her iki ebeveynden birer değişmiş kopya gerekir. Tek bir değişmiş kopyayla taşıyıcı olursunuz ve genellikle etkilenmezsiniz; her iki ebeveyn de taşıyıcıysa, her çocuğun ikisini birden miras alma olasılığı dörtte birdir.
SMPD1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 4,5 kb uzunluğunun 2,4 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.896 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi SMPD1 genini nasıl okur
349
SMPD1 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, SMPD1 genindeki 4,5 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 2,4 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase1 durumu paylaşıyor
- AGAaspartylglucosaminidase1 durumu paylaşıyor
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 11 durumu paylaşıyor
- ARSAarylsulfatase A1 durumu paylaşıyor
- ARSBarylsulfatase B1 durumu paylaşıyor
- ARSKarylsulfatase family member K1 durumu paylaşıyor
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 11 durumu paylaşıyor
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 61 durumu paylaşıyor
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, battenin1 durumu paylaşıyor
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthase1 durumu paylaşıyor
- CLN6CLN6 transmembrane ER protein1 durumu paylaşıyor
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC protein1 durumu paylaşıyor
SMPD1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, SMPD1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Ataxia
- Developmental stagnation
- Mental deterioration
22 özellik daha göster
- Motor delay
- Worsening neurological symptoms
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of the nervous system
- Delayed motor skills
- Dementia
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Neurodevelopmental delay
- Peripheral neuropathy
- Abnormality of the cerebellum
- Apraxia
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Bipolar disorder
- Brief seizures with staring spells
- Depression
- Specific learning disability
- Decreased reflex response
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
Laboratory abnormality
- Decreased acid sphingomyelinase activity
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Decreased circulating high-density lipoprotein cholesterol
- Elevated tissue sphingomyelin concentration
- High liver enzymes
- Increased plasma triglycerides
- Abnormal circulating lipid concentration
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormality of the coagulation cascade
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Acute promyelocytic leukemia
- Autoimmune thrombocytopenia
- Bleeding tendency
- Bone-marrow foam cells
- Microcytic anemia
1 özellik daha göster
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle degeneration
- Delayed bone maturation
- Low muscle tone
- Osteopenia
- Osteoporosis
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spontaneous fracture
- Muscle weakness
1 özellik daha göster
Abnormality of the respiratory system
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Abnormal blood gas level
- Decreased DLCO
- Interstitial pneumonitis
- Progressive pulmonary function impairment
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Breathing difficulty
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). SMPD1 geni: sphingomyelin phosphodiesterase 1. Erişim tarihi: 16 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/smpd1
Dante Labs. SMPD1 geni: sphingomyelin phosphodiesterase 1 [Internet]. [alıntı tarihi 16 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/smpd1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde