Gen
ALDH18A1
aldehyde dehydrogenase 18 family member A1
- HGNC 9722↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000059573↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 5832↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 10q24.1
- Koordinater
- Kromosom 10: 95.605.941–95.656.711 (GRCh38)
- Exoner
- 18 exoner fordelt over 50,8 kb
- Protein
- 795 aminosyrer
- Også kendt som
- P5CS
- Tidligere symboler
- GSAS, PYCS, SPG9
- MANE Select-transkript
- ENST00000371224.7NM_002860.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/aldh18a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ALDH18A1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Cutis Laxa
Cutis laxa (CL) er en arvelig eller erhvervet bindevævssygdom, kendetegnet ved rynket, overskydende og slap uelastisk hud, forbundet med skelet- og udviklingsmæssige afvigelser og i nogle tilfælde med alvorlig involvering af kroppens organer. Flere forskellige former for arvelig CL er beskrevet, som skelnes ud fra arvegangen og forskelle i omfanget af indre organinvolvering, tilhørende afvigelser og sygdommens sværhedsgrad.
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
P5CS-mangel (ALDH18A1-relateret)
- P5CS-mangel
P5CS-mangel skyldes ændringer i ALDH18A1, som koder for enzymet P5CS, der er nødvendigt for at danne prolin og ornithin. Den kan nedarves autosomal recessivt (ændringer i begge kopier) eller autosomal dominant, hvor en enkelt ændret kopi, ofte opstået de novo, forstyrrer enzymet.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Behandlingen omfatter øjenundersøgelse og operation for grumsethed, når det er nødvendigt, fysioterapi og behandling af spasticitet, støtte til udviklingen samt opfølgning af aminosyreniveauer i stofskiftet. Genetisk rådgivning anbefales, da både recessiv og dominant nedarvning forekommer; test af forældrene hjælper med at afklare risikoen for gentagelse.
Bredere grupperinger
Hereditær spastisk paraplegi
- Hereditær spastisk paraplegi (alle typer)
Et af 66 gener, der er knyttet til det
Samlebetegnelse for alle hereditære spastiske paraplegier, herunder SPG4 (SPAST), den hyppigste dominante form, samt SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 og SPG31.
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Arvelige neurodegenerative sygdomme
- KIF5A-relateret neurodegenerativ sygdomAutosomal dominant
Et af 372 gener, der er knyttet til det
Forårsaget af ændringer i den ene kopi af KIF5A, som koder for et motorprotein med en hale, der binder last. Forskellige typer ændringer fører til forskellige sygdomme: hereditær spastisk paraplegi type 10, en aksonal form for Charcot-Marie-Tooths sygdom og amyotrofisk lateral sklerose (ALS).
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Behandlingen er symptomatisk og afhænger af sygdomsbilledet og omfatter fysioterapi, medicin mod spasticitet og tværfaglig ALS-behandling. Hvert barn af en berørt person har 1 ud af 2 chance for at arve ændringen; genetisk rådgivning hjælper familier med at forstå dette.
Sådan er ALDH18A1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,4 kb af genets 50,8 kb; 2.388 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ALDH18A1
1Let
Hvor svær ALDH18A1 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i ALDH18A1 ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.
Det der forstærker det: andelen af ALDH18A1s eksoner i hver type svært område
- MappabilityStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der hører til her, kan mangle eller være forkert. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 100.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale regioner og den X-transponerede region, hvor chrX og chrY har den samme eller næsten samme sekvens, så et read fra den ene kan blive placeret på den anden. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- ReferencedækningHuller i referenceassemblyet i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, reads kan justeres til. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 50.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og løb af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 30.0,6 %
- GC-indholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 20.3,4 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af ALDH18A1s eksonbaser i den type svære region. En enkelt type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser ligger, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
55
positioner i ALDH18A1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i et område, som korte reads har svært ved.
En helgenomanalyse dækker alle 50,8 kb af ALDH18A1, inklusive introner, og ikke kun de 3,4 kb eksoner.
ClinVar pathogenic variants (57)
The ALDH18A1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 32
- Patogen/sandsynligvis patogen 1
- Sandsynligvis patogen 24
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.2246G>A (p.Arg749Gln) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.412C>T (p.Arg138Trp) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.2294G>A (p.Arg765Gln) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.2143G>C (p.Asp715His) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.377G>A (p.Arg126His) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome and 3 others | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.2117_2118del (p.Thr706fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1993C>T (p.Arg665Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1804del (p.Arg602fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1795del (p.Arg599fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1713dup (p.Lys572Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1702C>T (p.Gln568Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1596_1600del (p.Val533fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 3 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1499G>T (p.Gly500Val) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1375C>T (p.Arg459Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive complex spastic paraplegia type 9B | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1321C>T (p.Arg441Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 3 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1273C>T (p.Arg425Cys) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 3 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1227dup (p.Asp410fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.1111C>T (p.Arg371Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive complex spastic paraplegia type 9B and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.755G>A (p.Arg252Gln) (opens in a new tab) | P5CS deficiency and 4 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.754C>T (p.Arg252Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.741del (p.Asp247fs) (opens in a new tab) | ALDH18A1-related de Barsy syndrome and 3 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.684dup (p.Ala229fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.545del (p.Ile182fs) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.478G>T (p.Ala160Ser) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 9A | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_002860.4(ALDH18A1):c.475C>T (p.Arg159Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant spastic paraplegia type 9 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
See all 57 with every other ALDH18A1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deler 2 sygdomme
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeler 2 sygdomme
- AMFRautocrine motility factor receptorDeler 2 sygdomme
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Deler 2 sygdomme
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Deler 2 sygdomme
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Deler 2 sygdomme
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Deler 2 sygdomme
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deler 2 sygdomme
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Deler 2 sygdomme
- ATL1atlastin GTPase 1Deler 2 sygdomme
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Deler 2 sygdomme
- ATP7AATPase copper transporting alphaDeler 2 sygdomme
Træk knyttet til ALDH18A1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ALDH18A1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Absent speech development
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Overactive lower leg reflex
- Babinski sign
Vis 47 træk mere
- Hoffmann sign
- Upper limb hyperreflexia
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormality of pain sensation
- Autism spectrum disorder
- Brisk knee jerk
- Brisk reflexes
- Difficulty articulating speech
- Impaired distal vibration sensation
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Loss of ability to walk
- Motor delay
- Motor polyneuropathy
- Paralysis of all four limbs
- Postural tremor
- Progressive gait ataxia
- Upper motor neuron dysfunction
- Worsening neurological symptoms
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal spinal cord dorsal column morphology
- Abnormality of the cerebellum
- Balance impairment
- Corpus callosum atrophy
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of the spinal cord
- Delayed speech and language development
- Dementia
- Epilepsy
- Falls
- Focal dystonia
- Impaired vibration sensation at ankles
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Impaired vibratory sensation
- Inability to coordinate movements when walking
- Loss of articulate speech
- Loss of speech
- Memory impairment
- Peripheral axonal neuropathy
- Primitive reflex
- Psychosis
- Resting tremor
- Toe walking
- Tremor
- Abnormal shape of upper motor neuron
- Dysfunction of lateral corticospinal tracts
- Specific learning disability
Abnormality of the eye
- Corneal opacity
- Clouding of the lens of the eye
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Cross-eyed
- Drooping upper eyelid
- Horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormally close eyes
Vis 3 træk mere
Abnormality of the integument
- Dermal translucency
- Hanging skin
- Hyperelastic skin
- Premature skin wrinkling
- Fragmented elastic fibers in the dermis
- Increased number of skin folds
- Loose redundant skin
- Prematurely aged appearance
Vis 2 træk mere
Abnormality of the cardiovascular system
- Prominent superficial blood vessels
- Aortic regurgitation
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Mitral regurgitation
- Twisted cerebral arteries
- Cardiac failure
- Dilatation of the ventricular cavity
- Narrowing of aorta
Vis 1 træk mere
Abnormality of the digestive system
- Episodic vomiting
- Feeding difficulties
- Inguinal hernia
- Pseudobulbar paralysis
- Acid reflux
- Small bowel diverticula
- Vomiting
- Stomach hernia
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-19: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.19-9814e911.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ALDH18A1-genet: aldehyde dehydrogenase 18 family member A1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/aldh18a1
Dante Labs. ALDH18A1-genet: aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/aldh18a1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger