Gen
ARL6IP1
ARL6 interacting reticulophagy regulator 1
- HGNC 697↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000170540↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 23204↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 16p12.3
- Koordinater
- Kromosom 16: 18.791.669–18.801.549 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner fordelt over 9,9 kb
- Protein
- 203 aminosyrer
- Også kendt som
- AIP1, ARMER, KIAA0069, SPG61
- Tidligere symboler
- ARL6IP
- MANE Select-transkript
- ENST00000304414.12NM_015161.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/arl6ip1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ARL6IP1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Hereditær spastisk paraplegi
- Hereditær spastisk paraplegi (alle typer)
Et af 66 gener, der er knyttet til det
Samlebetegnelse for alle hereditære spastiske paraplegier, herunder SPG4 (SPAST), den hyppigste dominante form, samt SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 og SPG31.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Arvelige neurodegenerative sygdomme
- KIF5A-relateret neurodegenerativ sygdomAutosomal dominant
Et af 372 gener, der er knyttet til det
Forårsaget af ændringer i den ene kopi af KIF5A, som koder for et motorprotein med en hale, der binder last. Forskellige typer ændringer fører til forskellige sygdomme: hereditær spastisk paraplegi type 10, en aksonal form for Charcot-Marie-Tooths sygdom og amyotrofisk lateral sklerose (ALS).
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Behandlingen er symptomatisk og afhænger af sygdomsbilledet og omfatter fysioterapi, medicin mod spasticitet og tværfaglig ALS-behandling. Hvert barn af en berørt person har 1 ud af 2 chance for at arve ændringen; genetisk rådgivning hjælper familier med at forstå dette.
Sådan er ARL6IP1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,3 kb af genets 9,9 kb; 612 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ARL6IP1
5
positioner i ARL6IP1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 9,9 kb af ARL6IP1, inklusive introns, og ikke kun de 2,3 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (5)
The ARL6IP1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 3
- Sandsynligvis patogen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_015161.3(ARL6IP1):c.112C>T (p.Arg38Ter) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 61 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_015161.3(ARL6IP1):c.346C>T (p.Arg116Ter) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 61 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_015161.3(ARL6IP1):c.198_202del (p.Leu67fs) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 61 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_015161.3(ARL6IP1):c.409-2A>G (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 61 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_015161.3(ARL6IP1):c.407_409-197del (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia 61 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deler 2 sygdomme
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeler 2 sygdomme
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Deler 2 sygdomme
- AMFRautocrine motility factor receptorDeler 2 sygdomme
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Deler 2 sygdomme
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Deler 2 sygdomme
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Deler 2 sygdomme
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Deler 2 sygdomme
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deler 2 sygdomme
- ATL1atlastin GTPase 1Deler 2 sygdomme
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Deler 2 sygdomme
- B4GALNT1beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til ARL6IP1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ARL6IP1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ARL6IP1-genet: ARL6 interacting reticulophagy regulator 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/arl6ip1
Dante Labs. ARL6IP1-genet: ARL6 interacting reticulophagy regulator 1 [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/arl6ip1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger