Gen
GTF2H5
general transcription factor IIH subunit 5
- HGNC 21157↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000272047↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 404672↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 6q25.3
- Souřadnice
- Chromozom 6: 158 168 350–158 199 344 (GRCh38)
- Exony
- 3 exonů na 31 kb
- Protein
- 71 aminokyselin
- Další názvy
- FLJ30544, bA120J8.2, TTD-A, TFB5, TFIIH, TTDA
- Předchozí symboly
- C6orf175, TTD
- Transkript MANE Select
- ENST00000607778.2NM_207118.3
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gtf2h5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si GTF2H5 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
DNA Repair Disease
- Autozomálně recesivní
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je GTF2H5 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 7,5 kb z 31 kb genu; 216 těchto bází kódují protein.
Sekvenování GTF2H5
1
pozice v GTF2H5, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 31 kb genu GTF2H5, včetně intronů, nikoli jen 7,5 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- APTXaprataxinSdílí 1 onemocnění
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedSdílí 1 onemocnění
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedSdílí 1 onemocnění
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Sdílí 1 onemocnění
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Sdílí 1 onemocnění
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CSdílí 1 onemocnění
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Sdílí 1 onemocnění
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitSdílí 1 onemocnění
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitSdílí 1 onemocnění
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitSdílí 1 onemocnění
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitSdílí 1 onemocnění
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s GTF2H5
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit GTF2H5. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal pyramidal sign
- Cerebral dysmyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
- Difficulty articulating speech
Zobrazit ještě 11 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Spasticity and rigidity of muscles
- Absent fat below the skin
- Delayed bone maturation
- Generalized decreased muscle tone
- Increased bone mineral density
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint dislocation
- Multiple joint contractures
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen GTF2H5: general transcription factor IIH subunit 5. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/gtf2h5
Dante Labs. Gen GTF2H5: general transcription factor IIH subunit 5 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/gtf2h5
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů