Geeni
GTF2H5
general transcription factor IIH subunit 5
- HGNC 21157↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000272047↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 404672↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6q25.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 158 168 350–158 199 344 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 31 kb:n alueella
- Proteiini
- 71 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ30544, bA120J8.2, TTD-A, TFB5, TFIIH, TTDA
- Aiemmat symbolit
- C6orf175, TTD
- MANE Select -transkripti
- ENST00000607778.2NM_207118.3
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gtf2h5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue GTF2H5 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
DNA-korjausmekanismin häiriöön liittyvä sairaus
- Autosomaalinen resessiivinen
Sairaus, jonka taustalla on DNA:n korjausmekanismien häiriö.
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
GTF2H5-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,5 kb geenin 31 kb:stä; 216 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: GTF2H5
1
GTF2H5-geenin kohta, jossa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 31 kb geenistä GTF2H5, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 7,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- APTXaprataxinYhteinen sairaus: 1
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Yhteinen sairaus: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Yhteinen sairaus: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteinen sairaus: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseYhteinen sairaus: 1
Geeniin GTF2H5 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita GTF2H5 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal pyramidal sign
- Cerebral dysmyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
- Difficulty articulating speech
Näytä 11 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Spasticity and rigidity of muscles
- Absent fat below the skin
- Delayed bone maturation
- Generalized decreased muscle tone
- Increased bone mineral density
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint dislocation
- Multiple joint contractures
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). GTF2H5-geeni: general transcription factor IIH subunit 5. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gtf2h5
Dante Labs. GTF2H5-geeni: general transcription factor IIH subunit 5 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gtf2h5
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa