Geen
GTF2H5
general transcription factor IIH subunit 5
- HGNC 21157↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000272047↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 404672↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 6q25.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 6: 158 168 350–158 199 344 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 31 kb
- Valk
- 71 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ30544, bA120J8.2, TTD-A, TFB5, TFIIH, TTDA
- Varasemad tähised
- C6orf175, TTD
- MANE Select transkript
- ENST00000607778.2NM_207118.3
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gtf2h5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe GTF2H5 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas GTF2H5 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 7,5 kb kogupikkusega 31 kb; neist 216 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: GTF2H5
1
GTF2H5 positsioon, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu GTF2H5 geeni 31 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 7,5 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- APTXaprataxinJagab 1 haigust
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Jagab 1 haigust
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Jagab 1 haigust
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CJagab 1 haigust
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Jagab 1 haigust
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitJagab 1 haigust
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitJagab 1 haigust
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitJagab 1 haigust
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitJagab 1 haigust
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseJagab 1 haigust
Geeniga GTF2H5 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida GTF2H5 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal pyramidal sign
- Cerebral dysmyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
- Difficulty articulating speech
Näita veel 11 tunnust
Abnormality of the musculoskeletal system
- Spasticity and rigidity of muscles
- Absent fat below the skin
- Delayed bone maturation
- Generalized decreased muscle tone
- Increased bone mineral density
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint dislocation
- Multiple joint contractures
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). GTF2H5 geen: general transcription factor IIH subunit 5. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gtf2h5
Dante Labs. GTF2H5 geen: general transcription factor IIH subunit 5 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gtf2h5
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast