Gen
RNU7-1
RNA, U7 small nuclear 1
- HGNC 34033↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000238923↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 100147744↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 12p13.31
- Koordinatlar
- Kromozom 12: 6.943.816–6.943.878 (GRCh38)
- Eksonlar
- 0,1 kb boyunca 1 ekson
- Diğer adları
- U7.1
- Önceki semboller
- RNU7
- MANE Select transkripti
- ENST00000458811.1NR_023317.1
- Lokus türü
- Küçük nükleer RNA (snRNA)
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu7-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameRNU7-1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Aicardi-Goutières Sendromu
- Otozomal resesif
Aicardi-Goutières sendromu (AGS), bazal ganglion kalsifikasyonu, lökodistrofi ve beyin omurilik sıvısında (BOS) lenfositoz birlikteliği ile karakterize, kalıtsal, subakut bir ensefalopatidir.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Nadir Görülen Monogenik Otoinflamatuar Hastalıklar
- PTPN2 ilişkili otoinflamasyon ve otoimmüniteOtozomal dominant
PTPN2'deki varyantlardan kaynaklanan, kolit ve artrit dahil, erken başlangıçlı iltihabi ve otoimmün hastalık.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Daha geniş gruplar
Diğer Doğuştan İmmün Yetmezlikler
- Bağışıklık yetmezliğinin kalıtsal formu
Buna bağlı 114 gen arasından biri
Tek genlerdeki değişikliklerden kaynaklanan, vücudun enfeksiyonlarla savaşma veya iltihaplanmayı düzenleme becerisini etkileyen kalıtsal bağışıklık sistemi bozuklukları.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Kalıtsal Nörodejeneratif Hastalıklar
- KIF5A ile İlişkili Nörodejeneratif HastalıkOtozomal dominant
Buna bağlı 372 gen arasından biri
KIF5A genindeki bir kopyadaki değişikliklerden kaynaklanır. Bu gen, yük bağlayıcı bir kuyruğa sahip motor bir proteini kodlar. Farklı tipteki değişiklikler farklı hastalıklara yol açar: herediter spastik paraplejinin 10. tipi, Charcot-Marie-Tooth hastalığının aksonal bir formu ve amyotrofik lateral skleroz (ALS).
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Tedavi semptomlara yöneliktir ve tabloya bağlıdır; fizyoterapi, antispastisite ilaçları ve multidisipliner ALS bakımını içerir. Etkilenmiş bir kişinin her çocuğunun bu değişikliği miras alma olasılığı 2'de 1'dir; genetik danışmanlık ailelerin bunu anlamasına yardımcı olur.
Diğer Kalıtsal Lökodistrofiler
- Lökodistrofi (diğer ve belirtilmemiş tipler)
Buna bağlı 80 gen arasından biri
Beynin ve omuriliğin beyaz maddesi olan miyelinin hasar görmesine veya normal oluşumunun engellenmesine yol açan kalıtsal hastalıklar. Tipler, ilgili gene bağlı olarak otozomal resesif, otozomal dominant veya X’e bağlı kalıtım gösterir.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Spesifik genetik nedenin bilinmesi tanı arayışını sonlandırabilir, destekleyici bakım ve izlemeye yön verebilir, belirli bir tedavinin var olup olmadığını gösterebilir ve akrabaların test edilmesine olanak tanıyabilir.
RNU7-1 geninin yapısı
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 0,1 kb uzunluğunun 0,1 kb'sini oluşturur.
RNU7-1 Dizilemesi
0Kolay
RNU7-1 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
RNU7-1 geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.
Buna eklenen etken: RNU7-1 geninin ekzonlarının her bir zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya yanlış olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 100 puan alırdı.%0
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki, paralog ve psödogenler gibi, %90 veya daha yüksek özdeşlikle kopyalanmış segmental duplikasyonlar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- chrY ile ortak bölgelerchrX ve chrY'nin aynı veya neredeyse aynı diziyi taşıdığı pseudoautosomal bölgeler ve X'e transpoze olmuş bölge; bu nedenle bir chrX okuması chrY'ye yerleştirilmiş olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- Referans kapsamıYakınlardaki referans birleştirmesindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı yerler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 50 puan alırdı.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve tamamını kapsayamayabildiği ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarladığı diziler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 30 puan alırdı.%0
- GC içeriğiG ve C oranı %25'in altında veya %65'in üzerinde olan pencereler; kütüphane hazırlığı bu pencereleri seyrek kapsar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 20 puan alırdı.%0
Dante Labs'in, NIST'in zor dizilenen bölgelerin Genome in a Bottle haritaları üzerine kurulu kendi araştırmasından elde edilen bir Dante Labs puanı.Puanın hesaplanma biçimiHer çubuk, RNU7-1 geninin ekzon bazlarının o zor bölge türündeki payını gösterir. Her tür tek başına bir geni zor hale getirebilir ve her ek tür daha az katkı yapar: hiçbir bazın hiçbirinde yer almadığı durumda 0, her bazın tek bir yere yerleştirilemediği bölgede olduğu durumda 100.
4
ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı RNU7-1 içindeki konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom dizilemesi, intronlar dahil olmak üzere RNU7-1 geninin tamamını, yani 0,1 kb'ın tamamını kapsar; yalnızca 0,1 kb'lık ekzonları değil.
ClinVar pathogenic variants (5)
The RNU7-1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patojenik 1
- Patojenik/muhtemelen patojenik 1
- Muhtemelen patojenik 3
| Varyant | Conditions | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NR_023317.1(RNU7-1):n.28C>T (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 and 1 other | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.40_47del (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.28C>G (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.30A>G (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.27T>C (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ADARadenosine deaminase RNA specific5 durumu paylaşıyor
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 15 durumu paylaşıyor
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit A5 durumu paylaşıyor
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit B5 durumu paylaşıyor
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit C5 durumu paylaşıyor
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 15 durumu paylaşıyor
- TREX1three prime repair exonuclease 15 durumu paylaşıyor
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 12 durumu paylaşıyor
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial2 durumu paylaşıyor
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 12 durumu paylaşıyor
- ACER3alkaline ceramidase 32 durumu paylaşıyor
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 12 durumu paylaşıyor
RNU7-1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, RNU7-1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Brain degeneration
25 özellik daha göster
- Chronic CSF lymphocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Absent speech development
- Damage to nerves that sense feeling
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Difficulty sleeping
- Diffuse leukoencephalopathy
- Headache
- Lateral ventricle dilatation
- Peripheral neuropathy
- Self-mutilation
- Tremor
- Degeneration of the striatum
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-19 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.19-9814e911.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). RNU7-1 geni: RNA, U7 small nuclear 1. Erişim tarihi: 19 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/rnu7-1
Dante Labs. RNU7-1 geni: RNA, U7 small nuclear 1 [Internet]. [alıntı tarihi 19 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/rnu7-1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde