Gen
RNU7-1
RNA, U7 small nuclear 1
- HGNC 34033↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000238923↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 100147744↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12p13.31
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 6.943.816–6.943.878 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon over 0,1 kb
- Ook bekend als
- U7.1
- Eerdere symbolen
- RNU7
- MANE Select-transcript
- ENST00000458811.1NR_023317.1
- Type locus
- Klein nucleair RNA (snRNA)
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu7-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees RNU7-1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Aicardi-Goutières-syndroom
- Autosomaal recessief
Het Aicardi-Goutières-syndroom (AGS) is een erfelijke, subacute encefalopathie die wordt gekenmerkt door een combinatie van verkalking in de basale ganglia, leukodystrofie en lymfocytose in de liquor cerebrospinalis (CSF).
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Zeldzame monogene auto-inflammatoire ziekten
- Auto-inflammatie en auto-immuniteit gerelateerd aan PTPN2Autosomaal dominant
Vroeg begonnen inflammatoire en auto-immuunziekte, waaronder colitis en artritis, veroorzaakt door varianten in PTPN2.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Aangeboren immuundeficiëntie
Een van 114 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen van het immuunsysteem die worden veroorzaakt door veranderingen in één gen en die invloed hebben op hoe het lichaam infecties bestrijdt of ontstekingen reguleert.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Erfelijke neurodegeneratieve aandoeningen
- Met KIF5A samenhangende neurodegeneratieve aandoeningAutosomaal dominant
Een van 372 genen die hiermee verband houden
Veroorzaakt door veranderingen in één kopie van KIF5A, een motoreiwit met een staart die vracht bindt. Verschillende soorten veranderingen leiden tot verschillende aandoeningen: hereditaire spastische paraplegie type 10, een axonale vorm van de ziekte van Charcot-Marie-Tooth en amyotrofe laterale sclerose (ALS).
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
De zorg is symptomatisch en hangt af van het ziektebeeld; zij omvat fysiotherapie, medicijnen tegen spasticiteit en multidisciplinaire ALS-zorg. Elk kind van een aangedane persoon heeft een kans van 1 op 2 om de verandering te erven; erfelijkheidsadvies helpt gezinnen dit te begrijpen.
Overige erfelijke leukodystrofieën
- Leukodystrofie (overige en niet-gespecificeerde typen)
Een van 80 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen die de vorming van myeline, de witte stof van de hersenen en het ruggenmerg, beschadigen of normale vorming verhinderen. Afhankelijk van het betrokken gen volgen de verschillende typen autosomaal recessieve, autosomaal dominante of X-gebonden overerving.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de specifieke genetische oorzaak kan een diagnostisch zoektraject beëindigen, de ondersteunende zorg en controles sturen, laten zien of een specifieke behandeling bestaat, en het mogelijk maken familieleden te testen.
Opbouw van RNU7-1
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 0,1 kb van de 0,1 kb van het gen.
Sequencing van RNU7-1
0Makkelijk
Hoe moeilijk RNU7-1 is te sequencen met korte reads, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van RNU7-1 liggen op plaatsen waar korte reads correct worden uitgelijnd.
Wat dit verergert: het aandeel van de exonen van RNU7-1 in elk type moeilijke regio
- MapbaarheidStukken waar reads van 100 of 250 bp niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 100 krijgen.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- Gedeeld met chrYDe pseudoautosomale regio's en de X-getransponeerde regio, waar chrX en chrY dezelfde of bijna dezelfde sequentie bevatten, zodat een read van de ene op de andere kan worden geplaatst. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- ReferentiedekkingHiaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 50 krijgen.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 30 krijgen.0%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding slechts dun worden gedekt. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 20 krijgen.0%
Een Dante Labs-score op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt er gescoordElke balk is het aandeel van de exonbasen van RNU7-1 in dat type moeilijke regio. Elk type kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra type voegt steeds minder toe: 0 wanneer geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 wanneer elke base ligt waar reads niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst.
4
posities in RNU7-1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen ervan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een heel genoom dekt alle 0,1 kb van RNU7-1, inclusief de introns, en niet alleen de 0,1 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (5)
The RNU7-1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 1
- Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen 1
- Waarschijnlijk pathogeen 3
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NR_023317.1(RNU7-1):n.28C>T (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.40_47del (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.28C>G (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.30A>G (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NR_023317.1(RNU7-1):n.27T>C (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 9 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeelt 5 aandoeningen
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deelt 5 aandoeningen
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeelt 5 aandoeningen
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BDeelt 5 aandoeningen
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CDeelt 5 aandoeningen
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Deelt 5 aandoeningen
- TREX1three prime repair exonuclease 1Deelt 5 aandoeningen
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deelt 2 aandoeningen
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 2 aandoeningen
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deelt 2 aandoeningen
- ACER3alkaline ceramidase 3Deelt 2 aandoeningen
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan RNU7-1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RNU7-1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Brain degeneration
Toon 25 kenmerken meer
- Chronic CSF lymphocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Absent speech development
- Damage to nerves that sense feeling
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Difficulty sleeping
- Diffuse leukoencephalopathy
- Headache
- Lateral ventricle dilatation
- Peripheral neuropathy
- Self-mutilation
- Tremor
- Degeneration of the striatum
Externe links
Genrecords
Transcript
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-19: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.19-9814e911.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RNU7-1-gen: RNA, U7 small nuclear 1. Geraadpleegd op 20 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/rnu7-1
Dante Labs. RNU7-1-gen: RNA, U7 small nuclear 1 [Internet]. [geraadpleegd 20 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/rnu7-1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken