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Gène

CHST3

carbohydrate sulfotransferase 3

Résumé

Localisation cytogénétique
10q22.1
Coordonnées
Chromosome 10 : 71 964 395–72 013 558 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 49,2 kb
Protéine
479 acides aminés
Aussi appelé
C6ST, C6ST1
Transcrit MANE Select
ENST00000373115.5NM_004273.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CHST3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CHST3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 10, avec un crochet à l'emplacement de CHST3. CHST3 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 10, de 71 488 977 à 72 488 976.Chromosome 1010q22.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.371,6 Mb71,8 Mb72 Mb72,2 Mb72,4 MbCDH23 : 71 396 884–71 815 947, brin directCDH23C10orf105 : 71 711 701–71 737 838, brin inverseC10orf105VSIR : 71 747 556–71 773 608, brin inverseVSIRPSAP : 71 816 026–71 851 388, brin inversePSAPCHST3 : 71 964 395–72 013 558, brin directCHST3SPOCK2 : 72 059 016–72 089 032, brin inverseSPOCK2ASCC1 : 72 092 153–72 217 653, brin inverseASCC1ANAPC16 : 72 215 651–72 235 860, brin directANAPC16DDIT4 : 72 273 919–72 276 039, brin directDDIT4DNAJB12 : 72 332 830–72 355 167, brin inverseDNAJB12MICU1 : 72 355 297–72 626 134, brin inverseMICU1Schéma de CHST3 : 3 exons sur le brin direct du chromosome 10Exon 2 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 41 sites connus associés à une maladieExon 1 : 71 964 395–71 964 694, 300 basesExon 2 : 72 005 736–72 005 982, 247 basesExon 3 : 72 007 172–72 013 558, 6 387 bases1235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,9 kb sur les 49,2 kb du gène ; 1 440 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit CHST3

44

positions dans CHST3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 49,2 kb de CHST3, introns compris, et pas seulement les 6,9 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CHST3 : carbohydrate sulfotransferase 3. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/chst3

Vancouver

Dante Labs. Gène CHST3 : carbohydrate sulfotransferase 3 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/chst3

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