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Gene

CHST3

carbohydrate sulfotransferase 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
10q22.1
Coordinate
Cromosoma 10: 71.964.395–72.013.558 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 49,2 kb
Proteina
479 amminoacidi
Noto anche come
C6ST, C6ST1
Trascritto MANE Select
ENST00000373115.5NM_004273.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CHST3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CHST3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 10, con una parentesi dove si trova CHST3. CHST3 e 10 geni nelle vicinanze sul cromosoma 10, da 71.488.977 a 72.488.976.Cromosoma 1010q22.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.371,6 Mb71,8 Mb72 Mb72,2 Mb72,4 MbCDH23: 71.396.884–71.815.947, filamento direttoCDH23C10orf105: 71.711.701–71.737.838, filamento inversoC10orf105VSIR: 71.747.556–71.773.608, filamento inversoVSIRPSAP: 71.816.026–71.851.388, filamento inversoPSAPCHST3: 71.964.395–72.013.558, filamento direttoCHST3SPOCK2: 72.059.016–72.089.032, filamento inversoSPOCK2ASCC1: 72.092.153–72.217.653, filamento inversoASCC1ANAPC16: 72.215.651–72.235.860, filamento direttoANAPC16DDIT4: 72.273.919–72.276.039, filamento direttoDDIT4DNAJB12: 72.332.830–72.355.167, filamento inversoDNAJB12MICU1: 72.355.297–72.626.134, filamento inversoMICU1Diagramma di CHST3: 3 esoni sul filamento diretto del cromosoma 10Esone 2: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 3: 41 siti noti causativi di malattiaEsone 1: 71.964.395–71.964.694, 300 basiEsone 2: 72.005.736–72.005.982, 247 basiEsone 3: 72.007.172–72.013.558, 6387 basi1235′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,9 kb dei 49,2 kb del gene; 1440 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge CHST3

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posizioni in CHST3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 49,2 kb di CHST3, introni inclusi, non solo i 6,9 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CHST3: carbohydrate sulfotransferase 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/chst3

Vancouver

Dante Labs. Gene CHST3: carbohydrate sulfotransferase 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/chst3

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