Gen
PDHA1
pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1
- HGNC 8806↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000131828↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 5160↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xp22.12
- Souřadnice
- Chromozom X: 19 343 927–19 361 718 (GRCh38)
- Exony
- 11 exonů na 17,8 kb
- Protein
- 390 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- E1alpha
- Předchozí symboly
- PDHA
- Transkript MANE Select
- ENST00000422285.7NM_000284.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PDHA1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Pyruvate Dehydrogenase & Pyruvate Carboxylase Deficiency
- Pyruvate Dehydrogenase DeficiencyAutozomálně recesivní
Caused by variants in PDHA1 (X-linked, often new in the child) or in PDHB, DLAT, PDHX, DLD, PDP1 or LIAS, which can cause lactic acidosis, developmental delay, seizures and movement problems.
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows a ketogenic diet, avoidance of high-carbohydrate loads, and thiamine for responsive forms.
Širší skupiny
Leigh Syndrome
Jeden z 69 genů spojených s touto vazbou
A progressive neurological disease defined by specific neuropathological features associating brainstem and basal ganglia lesions.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je PDHA1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,3 kb z 17,8 kb genu; 1 173 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PDHA1
102
pozic v genu PDHA1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 17,8 kb genu PDHA1, včetně intronů, nikoli jen 3,3 kb exonů.
Varianty se stránkou (5)
Varianty genu PDHA1 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A169V | c.506C>T | Exon 5 | 19 353 169 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| R72C | c.214C>T | Exon 3 | 19 350 033 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| R304X | c.910C>T | Exon 10 | 19 358 926 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| R378C | c.1132C>T | Exon 11 | 19 359 612 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| W383Sfs*6 | c.1142_1145dup | Exon 11 | 19 359 619 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- DLATdihydrolipoamide S-acetyltransferaseSdílí 2 onemocnění
- DLDdihydrolipoamide dehydrogenaseSdílí 2 onemocnění
- PDHBpyruvate dehydrogenase E1 subunit betaSdílí 2 onemocnění
- PDHXpyruvate dehydrogenase complex component XSdílí 2 onemocnění
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Sdílí 1 onemocnění
- ATP5MKATP synthase membrane subunit kSdílí 1 onemocnění
- BTDbiotinidaseSdílí 1 onemocnění
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Sdílí 1 onemocnění
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ECHS1enoyl-CoA hydratase, short chain 1Sdílí 1 onemocnění
- ETHE1ETHE1 persulfide dioxygenaseSdílí 1 onemocnění
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s PDHA1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PDHA1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Cerebral palsy
- Clumsiness
- Delayed ability to sit
- Epilepsy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability
Zobrazit ještě 35 rysů
- Irritability
- Jerking
- Lethargy
- Progressive degeneration of movement
- Tremor
- Abnormal shape of brain
- Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebrum
- EEG with focal sharp waves
- EEG with focal spikes
- EEG with generalized sharp slow waves
- Gliosis
- Grand mal seizures
- IQ less than 20
- Lateral ventricle dilatation
- Ventriculomegaly
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Basal ganglia cysts
- Basal ganglia gliosis
- Basal ganglia necrosis
- Cerebellar cyst
- Cerebellar gliosis
- Drowsiness
- Dystonia
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intracranial cystic lesion
- More grooves in brain
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Periventricular leukomalacia
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Choreoathetosis
- Episodic ataxia
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Metabolic acidosis
- Abnormal CSF pyruvate family amino acid concentration
- Congenital lactic acidosis
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PDHA1: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pdha1
Dante Labs. Gen PDHA1: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pdha1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů