Geeni
PDHA1
pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1
- HGNC 8806↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000131828↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5160↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xp22.12
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 19 343 927–19 361 718 (GRCh38)
- Eksonit
- 11 eksonia 17,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 390 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- E1alpha
- Aiemmat symbolit
- PDHA
- MANE Select -transkripti
- ENST00000422285.7NM_000284.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PDHA1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Pyruvaattidehydrogenaasin ja pyruvaattikarboksylaasin puutos
- Pyruvaattidehydrogenaasin puutosAutosomaalinen resessiivinen
Aiheutuu PDHA1-geenin varianteista (X-kromosomaalinen, usein lapsessa uutena) tai PDHB-, DLAT-, PDHX-, DLD-, PDP1- tai LIAS-geenin varianteista, jotka voivat aiheuttaa laktatsidoosia, kehitysviivettä, kohtauksia ja liikehäiriöitä.
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedon avulla voidaan käyttää ketogeenistä ruokavaliota, välttää runsaasti hiilihydraatteja sisältäviä kuormituksia ja käyttää tiamiinia hoitoon vastaavissa muodoissa.
Laajemmat ryhmät
Leighin oireyhtymä
Yksi 69 siihen liittyvästä geenistä
Etenevä neurologinen sairaus, jolle ovat tunnusomaisia tietyt neuropatologiset piirteet, joissa aivorungon ja tyvitumakkeiden vauriot esiintyvät yhdessä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PDHA1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,3 kb geenin 17,8 kb:stä; 1 173 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PDHA1
102
PDHA1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 17,8 kb geenistä PDHA1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,3 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (5)
Tässä ovat PDHA1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A169V | c.506C>T | Eksoni 5 | 19 353 169 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R72C | c.214C>T | Eksoni 3 | 19 350 033 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R304X | c.910C>T | Eksoni 10 | 19 358 926 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R378C | c.1132C>T | Eksoni 11 | 19 359 612 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| W383Sfs*6 | c.1142_1145dup | Eksoni 11 | 19 359 619 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- DLATdihydrolipoamide S-acetyltransferaseYhteisiä sairauksia: 2
- DLDdihydrolipoamide dehydrogenaseYhteisiä sairauksia: 2
- PDHBpyruvate dehydrogenase E1 subunit betaYhteisiä sairauksia: 2
- PDHXpyruvate dehydrogenase complex component XYhteisiä sairauksia: 2
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP5MKATP synthase membrane subunit kYhteinen sairaus: 1
- BTDbiotinidaseYhteinen sairaus: 1
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Yhteinen sairaus: 1
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
- ECHS1enoyl-CoA hydratase, short chain 1Yhteinen sairaus: 1
- ETHE1ETHE1 persulfide dioxygenaseYhteinen sairaus: 1
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
Geeniin PDHA1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PDHA1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Cerebral palsy
- Clumsiness
- Delayed ability to sit
- Epilepsy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability
Näytä 35 piirrettä lisää
- Irritability
- Jerking
- Lethargy
- Progressive degeneration of movement
- Tremor
- Abnormal shape of brain
- Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebrum
- EEG with focal sharp waves
- EEG with focal spikes
- EEG with generalized sharp slow waves
- Gliosis
- Grand mal seizures
- IQ less than 20
- Lateral ventricle dilatation
- Ventriculomegaly
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Basal ganglia cysts
- Basal ganglia gliosis
- Basal ganglia necrosis
- Cerebellar cyst
- Cerebellar gliosis
- Drowsiness
- Dystonia
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intracranial cystic lesion
- More grooves in brain
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Periventricular leukomalacia
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Choreoathetosis
- Episodic ataxia
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Metabolic acidosis
- Abnormal CSF pyruvate family amino acid concentration
- Congenital lactic acidosis
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PDHA1-geeni: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pdha1
Dante Labs. PDHA1-geeni: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pdha1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa