Geen
PDHA1
pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1
- HGNC 8806↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000131828↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5160↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xp22.12
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 19 343 927–19 361 718 (GRCh38)
- Eksonid
- 11 eksonit, ulatus 17,8 kb
- Valk
- 390 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- E1alpha
- Varasemad tähised
- PDHA
- MANE Select transkript
- ENST00000422285.7NM_000284.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PDHA1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Defekt piruvaatdehüdrogenaasi ja piruvaatkarboksülaasi talitluses
- Piruvaatdehüdrogenaasi puudulikkusAutosoomne retsessiivne
Põhjustatud variantidest geenis PDHA1 (X-seotud, sageli lapsel tekkinud uue muutusena) või geenides PDHB, DLAT, PDHX, DLD, PDP1 või LIAS, mis võivad põhjustada laktatsidoosi, arengu viivitust, krampe ja liikumishäireid.
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Teadmine võimaldab ketogeenset dieeti, vältida suure süsivesikusisaldusega koormust ning ravimeetodina kasutada tiamiini vastuvõtlike vormide puhul.
Laiemad rühmad
Leigh'i sündroom
Üks 69 sellega seotud geenist
Progresseeruv neuroloogiline haigus, mida iseloomustavad spetsiifilised neuropatoloogilised tunnused, mis seovad ajutüve ja basaalganglionide kahjustused.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PDHA1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,3 kb kogupikkusega 17,8 kb; neist 1173 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PDHA1
102
kohad geenis PDHA1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PDHA1 17,8 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,3 kb).
Variandid, millel on leht (5)
Siin on PDHA1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A169V | c.506C>T | Ekson 5 | 19 353 169 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R72C | c.214C>T | Ekson 3 | 19 350 033 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R304X | c.910C>T | Ekson 10 | 19 358 926 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R378C | c.1132C>T | Ekson 11 | 19 359 612 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| W383Sfs*6 | c.1142_1145dup | Ekson 11 | 19 359 619 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- DLATdihydrolipoamide S-acetyltransferaseJagab 2 haigust
- DLDdihydrolipoamide dehydrogenaseJagab 2 haigust
- PDHBpyruvate dehydrogenase E1 subunit betaJagab 2 haigust
- PDHXpyruvate dehydrogenase complex component XJagab 2 haigust
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Jagab 1 haigust
- ATP5MKATP synthase membrane subunit kJagab 1 haigust
- BTDbiotinidaseJagab 1 haigust
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Jagab 1 haigust
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
- ECHS1enoyl-CoA hydratase, short chain 1Jagab 1 haigust
- ETHE1ETHE1 persulfide dioxygenaseJagab 1 haigust
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
Geeniga PDHA1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PDHA1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Cerebral palsy
- Clumsiness
- Delayed ability to sit
- Epilepsy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability
Näita veel 35 tunnust
- Irritability
- Jerking
- Lethargy
- Progressive degeneration of movement
- Tremor
- Abnormal shape of brain
- Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebrum
- EEG with focal sharp waves
- EEG with focal spikes
- EEG with generalized sharp slow waves
- Gliosis
- Grand mal seizures
- IQ less than 20
- Lateral ventricle dilatation
- Ventriculomegaly
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Basal ganglia cysts
- Basal ganglia gliosis
- Basal ganglia necrosis
- Cerebellar cyst
- Cerebellar gliosis
- Drowsiness
- Dystonia
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intracranial cystic lesion
- More grooves in brain
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Periventricular leukomalacia
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Choreoathetosis
- Episodic ataxia
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Metabolic acidosis
- Abnormal CSF pyruvate family amino acid concentration
- Congenital lactic acidosis
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PDHA1 geen: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pdha1
Dante Labs. PDHA1 geen: pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pdha1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast