Gen
KCNJ5
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 5
- HGNC 6266↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000120457↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 3762↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 11q24.3
- Souřadnice
- Chromozom 11: 128 891 356–128 921 163 (GRCh38)
- Exony
- 3 exonů na 29,8 kb
- Protein
- 419 aminokyselin
- Další názvy
- Kir3.4, CIR, KATP1, GIRK4, LQT13
- Transkript MANE Select
- ENST00000529694.6NM_000890.5
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si KCNJ5 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Monogenic Hypertension & Mineralocorticoid Disorders
- Familial HyperaldosteronismAutozomálně dominantní
A group of conditions, including glucocorticoid-remediable aldosteronism (CYP11B1/CYP11B2) and forms caused by CLCN2, KCNJ5 or CACNA1H, in which the adrenal glands make too much aldosterone, causing high blood pressure.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Knowing about it guides treatment (dexamethasone for glucocorticoid-remediable aldosteronism, aldosterone-blocking drugs more generally) and supports screening of relatives.
Jak je KCNJ5 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6,1 kb z 29,8 kb genu; 1 260 těchto bází kódují protein.
Sekvenování KCNJ5
1Nízká
Jak obtížně se KCNJ5 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází KCNJ5 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0,9 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.4,3 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.4,6 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
3
pozic v KCNJ5, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celé genomové sekvenování pokrývá všech 29,8 kb genu KCNJ5, včetně intronů, nejen 6,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s KCNJ5
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit KCNJ5. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- High blood pressure
- Palpitations
- Fainting spell
- Cardiac failure
- Prolonged QT interval
- Prolonged QTc interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Ventricular arrhythmia
Zobrazit ještě 14 rysů
- Abnormal T-wave
- Bidirectional ventricular ectopy
- Blood clot in artery of lung
- Extra heart beat
- Heart attack
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Left ventricular hypertrophy
- Permanent atrial fibrillation
- Polymorphic and polytopic ventricular extrasystoles
- Polymorphic ventricular tachycardia
- Prominent U wave
- Stretched and thinned heart muscle
- Torsade de pointes
- Heart stops beating
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen KCNJ5: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 5. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/kcnj5
Dante Labs. Gen KCNJ5: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 5 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/kcnj5
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů