Gen
HMGCL
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase
- HGNC 5005↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000117305↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 3155↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p36.11
- Souřadnice
- Chromozom 1: 23 801 885–23 825 429 (GRCh38)
- Exony
- 9 exonů na 23,5 kb
- Protein
- 325 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- HL, HMGCL1
- Transkript MANE Select
- ENST00000374490.8NM_000191.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si HMGCL i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Classic Organic Acidurias
- 3-Hydroxy-3-Methylglutaryl-CoA Lyase DeficiencyAutozomálně recesivní
Caused by variants in HMGCL, which can cause episodes of low blood sugar without ketones and metabolic acidosis, especially during fasting.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows avoidance of fasting, a low-protein, low-fat diet and an emergency plan.
Fatty Acid Oxidation & Carnitine Cycle Disorders
- Disorders of Fatty Acid Oxidation and KetogenesisAutozomálně recesivní
A group of enzyme and transporter defects, including MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD and HADH deficiency, primary carnitine deficiency and carnitine-acylcarnitine translocase deficiency, that can cause low blood sugar, muscle breakdown, heart and liver problems during periods of fasting or illness.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows avoidance of prolonged fasting, an emergency plan for illness and, where relevant, carnitine or dietary fat modification, which can prevent life-threatening episodes.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je HMGCL uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,6 kb z 23,5 kb genu; 978 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte HMGCL
89
pozic v genu HMGCL, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 23,5 kb genu HMGCL, včetně intronů, nikoli jen 1,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Sdílí 1 onemocnění
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainSdílí 1 onemocnění
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainSdílí 1 onemocnění
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainSdílí 1 onemocnění
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaSdílí 1 onemocnění
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaSdílí 1 onemocnění
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseSdílí 1 onemocnění
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseSdílí 1 onemocnění
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaSdílí 1 onemocnění
- HMGCS23-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2Sdílí 1 onemocnění
- SLC22A5solute carrier family 22 member 5Sdílí 1 onemocnění
- SLC25A20solute carrier family 25 member 20Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s HMGCL
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit HMGCL. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Metabolic acidosis
- Reduced HMG-CoA lyase activity in cultured fibroblasts
- 3-Methylglutaric aciduria
- Elevated serum anion gap
- High blood ammonia levels
- Low blood sugar
- Nonketotic hypoglycemia
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
Zobrazit ještě 16 rysů
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- High blood uric acid level
- High liver enzymes
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Lipid accumulation in hepatocytes
- Recurrent low blood sugar levels
- Dehydration
- Fever
- Fluid retention
- Ketonuria
- Hypothermia
- Elevated urinary 3-methylcrotonylglycine level
- Glutaric aciduria
- Increased level of 3-hydroxy-3-methylglutaric acid in urine
- Increased level of hippuric acid in urine
- Organic aciduria
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen HMGCL: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hmgcl
Dante Labs. Gen HMGCL: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hmgcl
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů