Gen
RPL11
ribosomal protein L11
- HGNC 10301↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000142676↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6135↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p36.11
- Souřadnice
- Chromozom 1: 23 691 806–23 696 835 (GRCh38)
- Exony
- 6 exonů na 5 kb
- Protein
- 178 aminokyselin
- Další názvy
- L11, uL5
- Transkript MANE Select
- ENST00000643754.2NM_000975.5
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rpl11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si RPL11 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Diamond-Blackfan Anemia
- Autozomálně dominantní
A congenital aregenerative and often macrocytic anemia with erythroblastopenia.
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je RPL11 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1 kb z 5 kb genu; 537 těchto bází kódují protein.
Sekvenování RPL11
0Nízká
Jak obtížně se RPL11 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází RPL11 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.0 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.0 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
39
pozic v RPL11, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celé genomové sekvenování pokrývá všech 5 kb genu RPL11, včetně intronů, nejen 1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- GATA1GATA binding protein 1Sdílí 1 onemocnění
- HEATR3HEAT repeat containing 3Sdílí 1 onemocnění
- RPL15ribosomal protein L15Sdílí 1 onemocnění
- RPL26ribosomal protein L26Sdílí 1 onemocnění
- RPL35Aribosomal protein L35aSdílí 1 onemocnění
- RPL5ribosomal protein L5Sdílí 1 onemocnění
- RPS10ribosomal protein S10Sdílí 1 onemocnění
- RPS17ribosomal protein S17Sdílí 1 onemocnění
- RPS19ribosomal protein S19Sdílí 1 onemocnění
- RPS24ribosomal protein S24Sdílí 1 onemocnění
- RPS26ribosomal protein S26Sdílí 1 onemocnění
- RPS29ribosomal protein S29Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s RPL11
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit RPL11. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen RPL11: ribosomal protein L11. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/rpl11
Dante Labs. Gen RPL11: ribosomal protein L11 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/rpl11
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů