Gen
HMGCL
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase
- HGNC 5005↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000117305↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 3155↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1p36.11
- Koordinater
- Kromosom 1: 23.801.885–23.825.429 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner fordelt over 23,5 kb
- Protein
- 325 aminosyrer
- Også kendt som
- HL, HMGCL1
- MANE Select-transkript
- ENST00000374490.8NM_000191.3
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hmgcl.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs HMGCL og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Klassiske organiske acidurier
- 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA-lyasemangelAutosomal recessiv
Forårsaget af varianter i HMGCL, som kan give episoder med lavt blodsukker uden ketoner og metabolisk acidose, især under faste.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden gør det muligt at undgå faste, følge en kost med lavt proteinindhold og lavt fedtindhold og have en plan for akut behandling.
Fedtsyreoxidations- og carnitinkredsløbsforstyrrelser
- Forstyrrelser i fedtsyreoxidation og ketogeneseAutosomal recessiv
En gruppe af enzym- og transportdefekter, herunder MCAD-, VLCAD-, LCHAD-, SCAD- og HADH-mangel, primær carnitinmangel og carnitin-acylcarnitin-translokasemangel, som kan forårsage lavt blodsukker, muskelnedbrydning samt hjerte- og leverproblemer i perioder med faste eller sygdom.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden gør det muligt at undgå længerevarende faste, at have en nødplan ved sygdom og, hvor det er relevant, at justere carnitin- eller kostfedtindtaget, hvilket kan forebygge livstruende episoder.
Sådan er HMGCL opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,6 kb af genets 23,5 kb; 978 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af HMGCL
89
positioner i HMGCL, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 23,5 kb af HMGCL, inklusive introner, og ikke kun de 1,6 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Deler 1 sygdom
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainDeler 1 sygdom
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainDeler 1 sygdom
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainDeler 1 sygdom
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaDeler 1 sygdom
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaDeler 1 sygdom
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseDeler 1 sygdom
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseDeler 1 sygdom
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaDeler 1 sygdom
- HMGCS23-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2Deler 1 sygdom
- SLC22A5solute carrier family 22 member 5Deler 1 sygdom
- SLC25A20solute carrier family 25 member 20Deler 1 sygdom
Træk knyttet til HMGCL
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, HMGCL kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Laboratory abnormality
- Metabolic acidosis
- Reduced HMG-CoA lyase activity in cultured fibroblasts
- 3-Methylglutaric aciduria
- Elevated serum anion gap
- High blood ammonia levels
- Low blood sugar
- Nonketotic hypoglycemia
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
Vis 16 træk mere
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- High blood uric acid level
- High liver enzymes
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Lipid accumulation in hepatocytes
- Recurrent low blood sugar levels
- Dehydration
- Fever
- Fluid retention
- Ketonuria
- Hypothermia
- Elevated urinary 3-methylcrotonylglycine level
- Glutaric aciduria
- Increased level of 3-hydroxy-3-methylglutaric acid in urine
- Increased level of hippuric acid in urine
- Organic aciduria
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). HMGCL-genet: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/hmgcl
Dante Labs. HMGCL-genet: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/hmgcl
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger