Gen
HGSNAT
heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase
- HGNC 26527↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000165102↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 138050↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 8p11.21-p11.1
- Souřadnice
- Chromozom 8: 43 140 464–43 202 855 (GRCh38)
- Exony
- 18 exonů na 62,4 kb
- Protein
- 635 aminokyselin
- Další názvy
- FLJ32731, HGNAT
- Předchozí symboly
- TMEM76
- Transkript MANE Select
- ENST00000379644.9NM_152419.3
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hgsnat.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si HGSNAT i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Mucopolysaccharidosis Type III (Sanfilippo Syndrome)
- Mucopolysaccharidosis type III (Sanfilippo syndrome types A, B, C and D)Autozomálně recesivní
Deficiency of one of four enzymes that break down heparan sulfate (SGSH in type A, NAGLU in type B, HGSNAT in type C, GNS in type D) causes speech delay, hyperactivity, sleep problems and progressive loss of skills in childhood.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 8 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
There is no approved disease-modifying therapy yet; a genetic diagnosis guides supportive care, family testing and eligibility for clinical trials.
Širší skupiny
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
Jeden z 59 genů spojených s touto vazbou
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 8 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Retinitis Pigmentosa
Jeden z 77 genů spojených s touto vazbou
A group of inherited retinal dystrophies with progressive loss of rod and then cone photoreceptors, causing night blindness and gradual loss of peripheral vision.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je HGSNAT uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,2 kb z 62,4 kb genu; 1 908 těchto bází kódují protein.
Sekvenování HGSNAT
196
pozic v HGSNAT, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 62,4 kb genu HGSNAT, včetně intronů, nikoli jen 5,2 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- GNSglucosamine (N-acetyl)-6-sulfataseSdílí 2 onemocnění
- NAGLUN-acetyl-alpha-glucosaminidaseSdílí 2 onemocnění
- SGSHN-sulfoglucosamine sulfohydrolaseSdílí 2 onemocnění
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Sdílí 1 onemocnění
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- AGAaspartylglucosaminidaseSdílí 1 onemocnění
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Sdílí 1 onemocnění
- AHRaryl hydrocarbon receptorSdílí 1 onemocnění
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Sdílí 1 onemocnění
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinSdílí 1 onemocnění
- ARL3ARF like GTPase 3Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s HGSNAT
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit HGSNAT. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the eye
- Retinal atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
Zobrazit ještě 28 rysů
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Macular crystals
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Ring scotoma
- Abnormal color vision
- Blind spot located at fixation point
- Blurred vision
- Epiretinal membrane
- Macular geographic atrophy
- Partial loss of field of vision
- Peripapillary atrophy
- Photopsia
- Limited peripheral vision
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen HGSNAT: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hgsnat
Dante Labs. Gen HGSNAT: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hgsnat
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů