Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

SET

SET nuclear proto-oncogene

Sammanfattning

Cytogenetisk position
9q34.11
Koordinater
Kromosom 9: 128 689 222–128 696 396 (GRCh38)
Exoner
8 exoner på 7,2 kb
Protein
277 aminosyror
Även känd som
PHAPII, 2PP2A, IPP2A2, TAF-IBETA, IGAAD, TAF-I
MANE Select-transkript
ENST00000322030.13NM_003011.4
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterad rapport som är relevant för denna gen

    Så är SET uppbyggd

    • Kodande sekvens
    • Otranslaterad region
    • Intron
    • Transkriptionsriktning
    • Kända sjukdomsorsakande ställen
    • Sträckor som korta läsningar har svårt för
    Kromosom 9, med en parentes där SET finns. SET och 33 gener i närheten på kromosom 9, från 128 192 809 till 129 192 808.Kromosom 99q34.11p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3128,2 Mb128,4 Mb128,6 Mb128,8 Mb129 MbCIZ1: 128 161 233–128 204 482, bakåt-strängCIZ1DNM1: 128 191 655–128 255 254, framåt-strängDNM1GOLGA2: 128 255 829–128 276 036, bakåt-strängGOLGA2SWI5: 128 275 379–128 316 123, framåt-strängSWI5TRUB2: 128 305 159–128 322 741, bakåt-strängTRUB2COQ4: 128 322 483–128 334 073, framåt-strängCOQ4SLC27A4: 128 340 475–128 363 283, framåt-strängSLC27A4URM1: 128 371 341–128 392 017, framåt-strängURM1CERCAM: 128 411 575–128 437 362, framåt-strängCERCAMODF2: 128 455 181–128 502 162, framåt-strängODF2GLE1: 128 504 655–128 543 874, framåt-strängGLE1SPTAN1: 128 552 558–128 633 663, framåt-strängSPTAN1DYNC2I2: 128 633 646–128 656 847, bakåt-strängDYNC2I2SET: 128 689 222–128 696 396, framåt-strängSETPKN3: 128 702 489–128 720 924, framåt-strängPKN3ZDHHC12: 128 720 862–128 724 146, bakåt-strängZDHHC12ZER1: 128 729 785–128 772 414, bakåt-strängZER1TBC1D13: 128 787 227–128 810 432, framåt-strängTBC1D13ENDOG: 128 818 451–128 822 683, framåt-strängENDOGSPOUT1: 128 819 651–128 829 838, bakåt-strängSPOUT1KYAT1: 128 819 663–128 881 931, bakåt-strängKYAT1KYAT1: 128 832 937–128 882 556, bakåt-strängLRRC8A: 128 882 120–128 918 042, framåt-strängLRRC8APHYHD1: 128 920 966–128 942 051, framåt-strängPHYHD1: 128 941 478–128 957 021, framåt-strängDOLK: 128 945 530–128 947 603, bakåt-strängDOLKNUP188: 128 947 681–129 007 836, framåt-strängNUP188SH3GLB2: 128 992 788–129 028 369, bakåt-strängSH3GLB2MIGA2: 129 036 614–129 072 094, framåt-strängMIGA2DOLPP1: 129 081 097–129 091 161, framåt-strängDOLPP1CRAT: 129 092 813–129 111 313, bakåt-strängCRATPTPA: 129 110 550–129 148 946, framåt-strängPTPA: 129 139 413–129 260 575, framåt-strängIER5L: 129 175 552–129 178 261, bakåt-strängIER5LDiagram över SET: 8 exoner på framåt-strängen av kromosom 9Exon 1: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 2: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 3: 4 kända sjukdomsorsakande ställenExon 4: 4 kända sjukdomsorsakande ställenExon 5: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 6: 4 kända sjukdomsorsakande ställenExon 7: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 128 689 222–128 689 655, 434 baserExon 2: 128 691 170–128 691 227, 58 baserExon 3: 128 691 858–128 692 000, 143 baserExon 4: 128 692 662–128 692 765, 104 baserExon 5: 128 692 868–128 692 981, 114 baserExon 6: 128 693 638–128 693 808, 171 baserExon 7: 128 693 896–128 694 042, 147 baserExon 8: 128 694 641–128 696 396, 1 756 baser123456785′3′

    Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

    Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

    Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

    Exoner utgör 2,9 kb av genens 7,2 kb, och 834 av dessa baser kodar för proteinet.

    Så läser ett genomtest SET

    24

    positioner i SET där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

    2 av dem (8,3 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

    • Low mappability (2 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

    En helgenomsanalys täcker alla 7,2 kb av SET, med introner inräknade, inte bara de 2,9 kb exoner.

    Varifrån detta kommer

    • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
    • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
    • GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
    • ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
    • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
    • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
    • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citera den här sidan

    APA

    Dante Labs. (u.å.). SET-genen: SET nuclear proto-oncogene. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/set

    Vancouver

    Dante Labs. SET-genen: SET nuclear proto-oncogene [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/set

    Ett test. Ett helt liv av svar.

    Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

    Beställ mitt Genome Test