Gen
DPAGT1
dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1
- HGNC 2995↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000172269↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1798↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q23.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 119 096 510–119 101 853 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 5,3 kb
- Protein
- 408 aminosyror
- Även känd som
- GPT, D11S366, DGPT, ALG7, CDG-Ij
- Tidigare symboler
- DPAGT2, DPAGT
- MANE Select-transkript
- ENST00000354202.9NM_001382.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dpagt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs DPAGT1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Kongenitalt myasteniskt syndrom
- Medfödda myastena syndrom (alla typer)
Samlingsbegrepp för alla medfödda myastena syndrom, inklusive de vanliga formerna med CHRNE, RAPSN, DOK7 och MUSK.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Många former svarar på särskilda läkemedel, till exempel pyridostigmin, salbutamol eller efedrin, och vilket som är rätt beror på vilken gen som är inblandad.
Medfødda glykosyleringsrubbningar
- DPAGT1-CDGAutosomalt recessiv
En medfödd glykosyleringsrubbning orsakad av varianter i DPAGT1, från svår sjukdom med flera organsystem till ett medfött myastent syndrom med bälte- och extremitetsmuskelsvaghet.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Den myastena formen kan svara på läkemedel som används vid medfödda myastena syndrom.
- Medfödda glykosyleringsrubbningar (CDG)
En av 98 gener kopplade till den
En stor grupp ärftliga tillstånd där sockerkedjor (glykaner) inte byggs eller fästs korrekt på proteiner och lipider, ofta med påverkan på hjärnan, levern, blodkoagulationen, tillväxten och många andra organsystem. De flesta är autosomalt recessiva, men vissa är X-bundna eller autosomalt dominanta.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är DPAGT1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,9 kb av genens 5,3 kb, och 1 227 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av DPAGT1
0Låg
Hur svår DPAGT1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av DPAGT1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.2,9 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
36
positioner i DPAGT1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 5,3 kb av DPAGT1, inklusive introner, inte bara de 1,9 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 2 tillstånd
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDelar 2 tillstånd
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDelar 2 tillstånd
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Delar 1 tillstånd
- AGRNagrinDelar 1 tillstånd
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till DPAGT1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som DPAGT1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Abnormal peripheral nervous system synaptic transmission
- Absent reflexes
- Epilepsy
- Favorable response of weakness to acetylcholine esterase inhibitors
- Intellectual disability, severe
Visa ytterligare 31 egenskaper
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Abnormal gait
- Abnormality of the cerebellum
- Aggressive behavior
- Autism
- Brain imaging abnormality
- CNS hypomyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with generalized slow activity
- Emotional poverty
- Epileptic encephalopathy
- Epileptic spasm
- Focal motor seizure
- Generalized brain degeneration
- Generalized myoclonic seizure
- Small cerebellum
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Waddling gait
- Absent speech development
- Akinesia
- Ataxia
- Head-banging
- Inability to walk
- Stereotypical body rocking
- Increased reflexes
- Intellectual disability
Abnormality of the musculoskeletal system
- Increased jitter at single fiber EMG
- Low muscle tone
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Decreased muscle tone in infant
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Fatigable weakness
- Generalized decreased muscle tone
- Muscle tissue disease
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Scoliosis
- Difficulty running
- Difficulty walking up stairs
- Double-Jointed
- Excessive inward curvature of lower spine
- Flexed joint that cannot be straightened
- Frequent falls
- Gowers sign
- Inability to make and keep healthy fat tissue
- Low muscle tone in trunk
- Muscle spasm
- Osteoporosis
- Permanent flexion of the finger or toe
- Poor head control
- Ragged-red muscle fibers
- Spasticity and rigidity of muscles
- Tired easily
- Type 1 muscle fiber predominance
- Weakness of outermost muscles
Abnormality of the eye
- Outward facing eye ball
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Astigmatism
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Diffuse optic disc pallor
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of limbs
- Curvature of little finger
- Single transverse palmar crease
- Dropped arches
- Limb-girdle muscle weakness
- Curvature of digit
- Generalized weakness of limb muscles
- Inability to straighten knee
- Long slender fingers
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). DPAGT1-genen: dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/dpagt1
Dante Labs. DPAGT1-genen: dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/dpagt1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor