Gene
PEX16
peroxisomal biogenesis factor 16
- HGNC 8857↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000121680↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 9409↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 11p11.2
- Coordinate
- Cromosoma 11: 45.909.663–45.917.877 (GRCh38)
- Esoni
- 11 esoni su 8,2 kb
- Proteina
- 336 amminoacidi
- Trascritto MANE Select
- ENST00000378750.10NM_004813.4
- Tipo di locus
- Protein-coding
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Disturbi dello spettro di Zellweger e dei perossisomi
- Disturbi della biogenesi dei perossisomi (spettro di Zellweger e condrodisplasia punctata rizomelica)Autosomica recessiva
Alterazioni in uno qualsiasi dei più di una dozzina di geni PEX, più spesso PEX1, interessano cervello, fegato, reni, ossa, occhi e udito, con una gravità che va da una malattia che limita la vita nella prima infanzia a lievi problemi di vista, udito e apprendimento.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
La diagnosi orienta il monitoraggio della funzionalità epatica, surrenalica, visiva e uditiva, l'eventuale supplementazione quando indicata, e il test di portatore per i familiari.
Raggruppamenti più ampi
Altre leucodistrofie ereditarie
- Leucodistrofia (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 80 geni collegati ad esso
Patologie ereditarie che danneggiano o impediscono la normale formazione della mielina, la sostanza bianca del cervello e del midollo spinale. A seconda del gene coinvolto, i diversi tipi seguono un'ereditarietà autosomica recessiva, autosomica dominante o legata al cromosoma X.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Conoscere la specifica causa genetica può porre fine a una ricerca diagnostica, guidare le cure di supporto e il monitoraggio, indicare se esiste un trattamento specifico e consentire il test dei familiari.
Struttura di PEX16
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 1,7 kb dei 8,2 kb del gene; 1011 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di PEX16
38
posizioni in PEX16 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 8,2 kb di PEX16, introni compresi, non solo i 1,7 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- PEX1peroxisomal biogenesis factor 1Condivide 2 condizioni
- PEX10peroxisomal biogenesis factor 10Condivide 2 condizioni
- PEX11Bperoxisomal biogenesis factor 11 betaCondivide 2 condizioni
- PEX12peroxisomal biogenesis factor 12Condivide 2 condizioni
- PEX13peroxisomal biogenesis factor 13Condivide 2 condizioni
- PEX14peroxisomal biogenesis factor 14Condivide 2 condizioni
- PEX19peroxisomal biogenesis factor 19Condivide 2 condizioni
- PEX2peroxisomal biogenesis factor 2Condivide 2 condizioni
- PEX26peroxisomal biogenesis factor 26Condivide 2 condizioni
- PEX3peroxisomal biogenesis factor 3Condivide 2 condizioni
- PEX5peroxisomal biogenesis factor 5Condivide 2 condizioni
- PEX6peroxisomal biogenesis factor 6Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a PEX16
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PEX16 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of movement
- Cognitive impairment
- Diminished deep tendon reflex
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
Mostra altri 26 tratti
- Profound global developmental delay
- Severe global developmental delay
- Abnormality of neuronal migration
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Brisk reflexes
- Corpus callosum atrophy
- Difficulty articulating speech
- Lack of coordination of movement
- Loss of ability to walk
- More grooves in brain
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Babinski sign
- Brain degeneration
- Clonus
- Degeneration of cerebellum
- Dysesthesia
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability
- Limb tremor
- Peripheral demyelination
- Peripheral neuropathy
- Toe walking
- Unsteady walk
- Cerebellar vermis atrophy
- Leukodystrophy
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the palate
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Flat face
- High forehead
- Long, narrow head
- Nasal tip, upturned
- Upward slanting of the opening between the eyelids
Mostra altri 13 tratti
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the liver
- Enlarged liver
- Feeding difficulties in infancy
- Jaundice
- Liver failure
- Constipation
- Malabsorption
- Pyloric stenosis
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-17: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PEX16: peroxisomal biogenesis factor 16. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pex16
Dante Labs. Gene PEX16: peroxisomal biogenesis factor 16 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pex16
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