Geen
PEX16
peroxisomal biogenesis factor 16
- HGNC 8857↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000121680↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 9409↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p11.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 45 909 663–45 917 877 (GRCh38)
- Eksonid
- 11 eksonit, ulatus 8,2 kb
- Valk
- 336 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- MANE Select transkript
- ENST00000378750.10NM_004813.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PEX16 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Zellwegeri spektri ja peroksisoomide biogeneesi häired
- Peroksisoomide biogeneesi häired (Zellwegeri spekter ja rhizomelne kondrodüsplaasia punktaat)Autosoomne retsessiivne
Muutused mis tahes enam kui tosinas PEX-geenis, kõige sagedamini PEX1-s, mõjutavad aju, maksa, neerusid, luid, silmi ja kuulmist. Raskusaste ulatub elu piiravast haigusest imikueas kuni kergemate nägemis-, kuulmis- ja õppimisraskusteni.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos suunab maksa, neerupealiste, nägemise ja kuulmise talitluse jälgimist, vajadusel toidulisandite kasutamist ning sugulaste kandjatesti.
Laiemad rühmad
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PEX16 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,7 kb kogupikkusega 8,2 kb; neist 1011 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PEX16
38
kohad geenis PEX16, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PEX16 8,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,7 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PEX1peroxisomal biogenesis factor 1Jagab 2 haigust
- PEX10peroxisomal biogenesis factor 10Jagab 2 haigust
- PEX11Bperoxisomal biogenesis factor 11 betaJagab 2 haigust
- PEX12peroxisomal biogenesis factor 12Jagab 2 haigust
- PEX13peroxisomal biogenesis factor 13Jagab 2 haigust
- PEX14peroxisomal biogenesis factor 14Jagab 2 haigust
- PEX19peroxisomal biogenesis factor 19Jagab 2 haigust
- PEX2peroxisomal biogenesis factor 2Jagab 2 haigust
- PEX26peroxisomal biogenesis factor 26Jagab 2 haigust
- PEX3peroxisomal biogenesis factor 3Jagab 2 haigust
- PEX5peroxisomal biogenesis factor 5Jagab 2 haigust
- PEX6peroxisomal biogenesis factor 6Jagab 2 haigust
Geeniga PEX16 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PEX16 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of movement
- Cognitive impairment
- Diminished deep tendon reflex
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Loss of developmental milestones
Näita veel 26 tunnust
- Profound global developmental delay
- Severe global developmental delay
- Abnormality of neuronal migration
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Brisk reflexes
- Corpus callosum atrophy
- Difficulty articulating speech
- Lack of coordination of movement
- Loss of ability to walk
- More grooves in brain
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Babinski sign
- Brain degeneration
- Clonus
- Degeneration of cerebellum
- Dysesthesia
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability
- Limb tremor
- Peripheral demyelination
- Peripheral neuropathy
- Toe walking
- Unsteady walk
- Cerebellar vermis atrophy
- Leukodystrophy
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the palate
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Flat face
- High forehead
- Long, narrow head
- Nasal tip, upturned
- Upward slanting of the opening between the eyelids
Näita veel 13 tunnust
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the liver
- Enlarged liver
- Feeding difficulties in infancy
- Jaundice
- Liver failure
- Constipation
- Malabsorption
- Pyloric stenosis
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PEX16 geen: peroxisomal biogenesis factor 16. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pex16
Dante Labs. PEX16 geen: peroxisomal biogenesis factor 16 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pex16
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast