Gene
CHD8
chromodomain helicase DNA binding protein 8
- HGNC 20153↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000100888↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 57680↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 14q11.2
- Coordinate
- Cromosoma 14: 21.385.199–21.456.123 (GRCh38)
- Esoni
- 38 esoni su 70,9 kb
- Proteina
- 2581 amminoacidi
- Noto anche come
- KIAA1564, DUPLIN
- Simboli precedenti
- HELSNF1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000646647.2NM_001170629.2
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Disturbo dello spettro autistico
Uno spettro di disturbi dello sviluppo che comprende l'autismo e la sindrome di Asperger. I segni e i sintomi includono difficoltà comunicative, interazioni sociali deficitarie e comportamenti ripetitivi.
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
▶Azionabilità
Servizi di intervento precoce, terapia comportamentale, logopedia e terapia occupazionale, psicofarmacologia per i sintomi associati
- Autismo, suscettibilità a (forme monogeniche)
Contributi monogenici all'autismo, comprese le varianti in NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1 e CHD8.
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Disabilità intellettiva
Uno di 233 geni collegati ad esso
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
Struttura di CHD8
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 8,5 kb dei 70,9 kb del gene; 7746 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di CHD8
1Bassa
Quanto è difficile sequenziare CHD8 con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di CHD8 che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.4,8%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.0%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
100
posizioni in CHD8 in cui ClinVar classifica una variante come patogenica o probabilmente patogenica
Nessuna di queste cade in una regione che le letture corte faticano a sequenziare.
Un genoma intero copre tutti i 70,9 kb di CHD8, introni inclusi, e non solo i 8,5 kb degli esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- PTCHD1patched domain containing 1Condivide 2 condizioni
- TBR1T-box brain transcription factor 1Condivide 2 condizioni
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Condivide 1 condizione
- ADKadenosine kinaseCondivide 1 condizione
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxCondivide 1 condizione
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Condivide 1 condizione
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Condivide 1 condizione
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseCondivide 1 condizione
- ANK3ankyrin 3Condivide 1 condizione
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Condivide 1 condizione
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Condivide 1 condizione
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Condivide 1 condizione
Tratti collegati a CHD8
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che CHD8 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Clumsiness
- Difficulty sleeping
- Echoing another person's speech
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Late chronotype
- Pica
- Pronoun reversal
Mostra altri 34 tratti
- Recurrent hand flapping
- Reduced production of gestures
- Short attention span
- Stereotypic upper-extremity movements
- Delayed speech and language development
- Limb dystonia
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Stereotypical hand wringing
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Autism
- Cerebellar vermis atrophy
- Difficulty falling asleep
- Epilepsy
- Generalized dystonia
- Increased appetite
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Loss of developmental milestones
- Poor social interactions
- Self-injurious behavior
- Writer's cramp
- Cerebral palsy
- Depression
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Intellectual disability, borderline
- Intellectual disability, severe
- Psychosis
- Slurred speech
- Tic disorder
- Ventriculomegaly
- IQ less than 20
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati nel 2026-10-17: le condizioni a cui il gene è associato e il grado di associazione.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: i siti noti che causano malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.18-e609d43e.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene CHD8: chromodomain helicase DNA binding protein 8. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/chd8
Dante Labs. Gene CHD8: chromodomain helicase DNA binding protein 8 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/chd8
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